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Enregistrement W2468812408 · doi:10.1111/efp.12283

Enhancement of antifungal activity of <i>Burkholderia pyrrocinia </i><scp>JK</scp>‐<scp>SH</scp>007 genetically modified with <i>Bacillus subtilis Chi113</i> gene

2016· article· en· W2468812408 sur OpenAlexfundno aff
Liumei He, Jianren Ye, Jia Hong Ren, Lin Huang, Xue-Lian Wu

Notice bibliographique

RevueForest Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesShandong Academy of SciencesNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of Calgary
Mots-clésBiologyBacillus subtilisMolecular biologyMicrobiologyChitinasePlasmidReporter geneTransformation (genetics)GeneGene expressionBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Previous studies showed that Burkholderia pyrrocinia JK‐SH007 is a potential biocontrol agent of poplar canker disease. In this report, B. pyrrocinia JK‐SH007 was genetically modified by introducing the Bacillus subtilis Chi113 gene to enhance its antifungal activity. The green fluorescence of B. pyrrocinia JK‐SH007E1 can be detected because of its transformation with plasmid pHKT2‐Chi113 containing a gfp reporter gene. Real‐time quantitative PCR (qPCR) showed that the B. subtilis Chi113 gene was highly expressed in B. pyrrocinia JK‐SH007E1 at mRNA level. The chitinase activity and the antifungal activity of B. pyrrocinia JK‐SH007E1 were significantly increased, and the clear halo was visible on the colloidal chitin agar plate. In addition, the constructed recombinant plasmid pHKT2‐Chi113 was stably maintained for at least 100 generations in the absence of antibiotic selection in B. pyrrocinia JK‐SH007E1. In western blot analysis, the Chi113‐GFP fusion protein was detected in B. pyrrocinia JK‐SH007E1 using the GFP polyclonal antibody. In conclusion, the B. subtilis Chi113 gene was successfully transformed into B. pyrrocinia JK‐SH007 and was expressed both at mRNA level and protein level. Moreover, the antifungal activity of B. pyrrocinia JK‐SH007 was improved through this genetic modification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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