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Enregistrement W2469138040

Insights into the Interactions between CFTR and Small Molecule Modulators

2014· dissertation· en· W2469138040 sur OpenAlexaboutno aff
Stanislav Pasyk

Notice bibliographique

RevueTSpace (University of Toronto) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPotentiatorChloride channelCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorMutantEndoplasmic reticulumCystic fibrosisPhosphorylationChemistryCell biologyΔF508MutationBiologyBiochemistryPharmacologyGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic Fibrosis (CF) is a life-threatening autosomal recessive disease affecting 1:3600 children born in Canada. CF is caused by mutations in the Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) chloride channel. The most common disease causing mutation is a deletion of residue F508, resulting in a structurally compromised protein which is retained in the endoplasmic reticulum and targeted for proteasomal degradation. Therapeutic strategies currently being pursued to alleviate the afflictions caused by this and other mutants include the use of corrector compounds to modify the surface expression of the channel, and potentiator compounds to increase cAMP-mediated channel activity. Despite the discovery of a number of small molecules affecting CFTR, much is still unknown about the nature of these interactions. This thesis contains the investigation of two potentiators: VRT-532 and VX-770, and two correctors VX-809 and C18. We assessed the consequences of interactions with these drugs on CFTR channel activity, ATPase activity and phosphorylation. We demonstrated that VRT-532 binds directly to mutant CFTR to modify its channel and ATPase activity. VX-770, known to bind directly to CFTR, can stimulate channel activity in the absence of cAMP stimulation in baby hamster kidney (BHK) cells. Correctors VX-809 and C18, based off the same molecular scaffold, are both capable of acutely augmenting cAMP-stimulated channel activity, providing evidence for potentiator activities in these compounds. Quantitative mass spectrometry (MS) techniques demonstrate a defect in phosphorylation at Ser-660 in the regulatory (R) domain in the major mutant. Treatment with C18 was unable to repair this defect. These novel findings regarding interactions between several small molecules and CFTR contributes to the understanding of the mechanism of action of these compounds, and will help identify how they may be modified for greater efficacy to improve the treatment of CF disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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