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Enregistrement W2471120943 · doi:10.1007/s13402-014-0171-y

Identification of GPM6A and GPM6B as potential new human lymphoid leukemia-associated oncogenes

2014· article· en· W2471120943 sur OpenAlexafffund
Cyndia Charfi, Elsy Edouard, Éric Rassart

Notice bibliographique

RevueCellular Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité du Québec à Montréal
Mots-clésBiologyFlow cytometryGeneImmunofluorescenceBlotGene expressionLeukemiaMolecular biologyCancer researchAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Previously, we found that the Graffi murine leukemia virus (MuLV) is able to induce a wide spectrum of hematologic malignancies in vivo. Using high-density oligonucleotide microarrays, we established the gene expression profiles of several of these malignancies, thereby specifically focusing on genes deregulated in the lymphoid sub-types. We observed over-expression of a variety of genes, including Arntl2, Bfsp2, Gfra2, Gpm6a, Gpm6b, Nln, Fbln1, Bmp7, Etv5 and Celsr1 and, in addition, provided evidence that Fmn2 and Parm-1 may act as novel oncogenes. In the present study, we assessed the expression patterns of eight selected human homologs of these genes in primary human B-cell malignancies, and explored the putative oncogenic potential of GPM6A and GPM6B. METHODS: The gene expression levels of the selected human homologs were tested in human B-cell malignancies by semi-quantitative RT-PCR. The protein expression profiles of human GPM6A and GPM6B were analyzed by Western blotting. The localization and the effect of GPM6A and GPM6B on the cytoskeleton were determined using confocal and indirect immunofluorescence microscopy. To confirm the oncogenic potential of GPM6A and GPM6B, classical colony formation assays in soft agar and focus forming assays were used. The effects of these proteins on the cell cycle were assessed by flow cytometry analysis. RESULTS: Using semi-quantitative RT-PCR, we found that most of the primary B-cell malignancies assessed showed altered expression patterns of the genes tested, including GPM6A and GPM6B. Using confocal microscopy, we found that the GPM6A protein (isoform 3) exhibits a punctate cytoplasmic localization and that the GPM6B protein (isoform 4) exhibits a peri-nuclear and punctate cytoplasmic localization. Interestingly, we found that exogenous over-expression of both proteins in NIH/3T3 cells alters the actin and microtubule networks and induces the formation of long filopodia-like protrusions. Additionally, we found that these over-expressing NIH/3T3 cells exhibit anchorage-independent growth and enhanced proliferation rates. Cellular transformation (i.e., loss of contact inhibition) was, however, only observed after exogenous over-expression of GPM6B. CONCLUSIONS: Our results indicate that several human homologs of the genes found to be deregulated in Graffi MuLV experimental mouse models may serve as candidate biomarkers for human B-cell malignancies. In addition, we found that GPM6A and GPM6B may act as novel oncogenes in the development of these malignancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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