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Enregistrement W2471390377 · doi:10.1111/mec.13738

Plant adaptive radiation mediated by polyploid plasticity in transcriptomes

2016· article· en· W2471390377 sur OpenAlex
Rie Shimizu‐Inatsugi, Aika Terada, Kyosuke Hirose, Hiroshi Kudoh, Jun Sese, Kentaro K. Shimizu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensArtificial Intelligence in Medicine (Canada)
Organismes subventionnairesPrecursory Research for Embryonic Science and TechnologyInstitute of GeneticsJapan Science and Technology AgencyUniversität ZürichResearch Organization of Information and SystemsNational Science FoundationHuman Frontier Science ProgramSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésPolyploidBiologyPloidyBotanyGenetic algorithmEvolutionary biologyPlant evolutionReproductive isolationGenomeGeneticsGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The habitats of polyploid species are generally distinct from their parental species. Stebbins described polyploids as 'general purpose genotypes', which can tolerate a wide range of environmental conditions. However, little is known about its molecular basis because of the complexity of polyploid genomes. We hypothesized that allopolyploid species might utilize the expression patterns of both parents depending on environments (polyploid plasticity hypothesis). We focused on hydrological niche segregation along fine-scale soil moisture and waterlogging gradients. Two diploid species, Cardamine amara and Cardamine hirsuta, grew best in submerged and unsubmerged conditions, respectively, consistent with their natural habitats. Interestingly, the allotetraploid Cardamine flexuosa derived from them grew similarly in fluctuating as well as submerged and unsubmerged conditions, consistent with its wide environmental tolerance. A similar pattern was found in another species trio: allotetraploid Cardamine scutata and its parents. Using the close relatedness of Cardamine and Arabidopsis, we quantified genomewide expression patterns following dry and wet treatments using an Arabidopsis microarray. Hierarchical clustering analysis revealed that the expression pattern of C. flexuosa clustered with C. hirsuta in the dry condition and with C. amara in the wet condition, supporting our hypothesis. Furthermore, the induction levels of most genes in the allopolyploid were lower than in a specialist diploid species. This reflects a disadvantage of being allopolyploid arising from fixed heterozygosity. We propose that recurrent allopolyploid speciation along soil moisture and waterlogging gradients confers niche differentiation and reproductive isolation simultaneously and serves as a model for studying the molecular basis of ecological speciation and adaptive radiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,894
Score d'incertitude au seuil0,881

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle