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Enregistrement W2472554430 · doi:10.1093/cz/zow077

Animated images in the analysis of zebrafish behavior

2016· article· en· W2472554430 sur OpenAlexaff
Robert Gerlai

Notice bibliographique

RevueCurrent Zoology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishStimulus (psychology)EthologyAnimal behaviorNeurosciencePopularityBehavioral neurosciencePsychologyBehavioural sciencesNoveltyBehavioral analysisCognitive scienceCognitive psychologyBiologyEcologySocial psychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This invited review is based upon a recent oral paper I presented at the Virtual Reality Symposium of the 34th International Ethological Conference (2015, Cairns, Australia), and as such it describes studies conducted mainly in my own laboratory. It reviews how we utilized visual stimuli for inducing behavioral responses in the zebrafish with a focus on shoaling, group forming behavior. The zebrafish is gaining increasing popularity in neuroscience. With this interest, its behavior is also more frequently studied. One of the many advantages of the zebrafish over traditional laboratory rodents is that this species is diurnal, and it relies heavily upon its visual system. Thus, similarly to our own species, zebrafish respond to visual stimuli in a robust and easily quantifiable manner. For the past decade, we have been exploring how to use such visual stimuli, and have developed numerous paradigms with which we can induce and quantify a variety of behavioral responses, including shoaling. This review summarizes some of these studies, and discusses questions including whether one should use live fish as stimulus, whether and how one could present animated (moving images) of fish, and how one could optimize a range of stimulus presentation parameters to elicit the most robust responses in zebrafish. Although the zebrafish is a relative newcomer in ethology and behavioral neuroscience, and although many of our findings only represent the first steps in this research, our results suggest that the behavioral analysis of the zebrafish will have an important place in biomedical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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