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Enregistrement W2473025746 · doi:10.1021/acs.est.6b01890

Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ is a Sensitive Target for Oil Sands Process-Affected Water: Effects on Adipogenesis and Identification of Ligands

2016· article· en· W2473025746 sur OpenAlexafffund
Hui Peng, Jianxian Sun, Hattan A. Alharbi, Paul D. Jones, John P. Giesy, Steve Wiseman

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePetroleum Processing and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesState Administration of Foreign Experts AffairsWestern Economic Diversification CanadaChinese Academy of SciencesSyncrudeNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésAdipogenesisChemistryPeroxisome proliferator-activated receptorPeroxisomeReceptorBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identification of toxic components of complex mixtures is a challenge. Here, oil sands process-affected water (OSPW) was used as a case study to identify those toxic components with a known protein target. Organic chemicals in OSPW exhibited dose-dependent activation of peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ) at concentrations less than those currently in the environment (0.025× equivalent of full-strength OSPW), by use of a luciferase reporter gene assay. Activation of PPARγ-mediated adipogenesis by OSPW was confirmed in 3T3L1 preadipocytes, as evidenced by accumulation of lipids and up-regulation of AP2, LPL, and PPARγ gene expression after exposure to polar fractions of OSPW. Unexpectedly, the nonpolar fractions of OSPW inhibited differentiation of preadipocytes via activation of the Wnt signaling pathway. Organic chemicals in OSPW that were ligands of PPARγ were identified by use of a pull-down system combined with untargeted chemical analysis (PUCA), with a recombinant PPARγ protein. Thirty ligands of PPARγ were identified by use of the PUCA assay. High resolution MS(1) and MS(2) spectra were combined to predict the formulas or structures of a subset of ligands, and polyoxygenated or heteroatomic chemicals, especially hydroxylated carboxylic/sulfonic acids, were the major ligands of PPARγ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,465

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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