Centralized Breast Cancer Biomarker Testing: A Value-Added Role in Guiding Patient Management
Notice bibliographique
Résumé
A characteristic of breast biomarker testing in British Columbia is its extensive centralization at the British Columbia Cancer Agency (BCCA). For each block submitted to BCCA for biomarker testing, a hematoxylin and eosin (H&E)-stained slide is reviewed, and if deemed appropriate, assays for estrogen receptor, progesterone receptor and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) are performed. Since biomarker testing centralization a number of discrepant results were encountered, this study was conducted to determine reasons for discrepancies. Prospectively (over 1-year period), biomarker testing was performed on 2,439 patients. Two hundred fifty-three cases involved solely testing for HER2 gene expression with fluorescence in situ hybridization, so the total number of cases examined was 2,186. Discrepant diagnoses and reasons for disagreements were recorded. The discrepancy rate from the 2186 cases was approximately 0.9% (19 cases): 11 cases were initially reported as invasive breast carcinoma, 7 cases as ductal carcinoma in situ (DCIS) and 1 case as benign. Twelve (63%) of 19 discrepant diagnoses arose from core biopsies. Eight invasive cases were changed to a noninvasive lesion (DCIS, atypical apocrine adenosis, sclerosing papillary lesion, sclerosing adenosis and complex sclerosing lesion) and three invasive cases were changed to another malignancy (pleomorphic lobular carcinoma, diffuse large B-cell lymphoma and plasma cell myeloma). Of seven discrepant cases involving DCIS, three showed evidence of invasion, whereas the remaining fourcases did not show evidence of DCIS (instead showed flat epithelial atypia, atypical ductal hyperplasia, atypical papillary lesion and benign breast parenchyma). One case which was initially reported as benign showed invasive carcinoma. Centralization of biomarker assays offers many benefits, including accredited standardized staining protocols and consistency with interpretation. It is an invaluable practice that may drastically affect patient care, ensuring patients are managed appropriately.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,021 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».