Untargeted Identification of Organo-Bromine Compounds in Lake Sediments by Ultrahigh-Resolution Mass Spectrometry with the Data-Independent Precursor Isolation and Characteristic Fragment Method
Notice bibliographique
Résumé
While previous studies have found that unknown natural and synthetic organo-bromine compounds (NSOBCs) contributed more than 99% of the total organic bromine (Br) in the environment, there was no efficient method for untargeted screening to identify NSOBCs in environmental matrixes. A novel untargeted method for identifying NSOBCs, based on ultrahigh-resolution mass spectrometry (UHRMS) with the Q Exactive instrument was developed. This method included a data-independent precursor isolation and characteristic fragment (DIPIC-Frag) procedure to identify NSOBCs. A total of 180 successive 5-m/z-wide windows were used to isolate precursor ions. This resulted in a sufficient dynamic range and specificity to identify peaks of Br fragment ions for analysis. A total of 2520 peaks of NSOBC compounds containing Br were observed in sediments from Lake Michigan, United States. A new chemometric strategy which combined chromatographic profiles, isotopic peaks, precursor isolation window information, and intensities was used to identify precursor ions and chemical formulas for detecting NSOBCs. Precursor ions for 2163 of the 2520 NSOBCs peaks (86%) were identified, and chemical formulas for 2071 NSOBCs peaks (82%) were determined. After exclusion of isotopic peaks, 1593 unique NSOBCs were identified and chemical formulas derived for each. Most of the compounds identified had not been reported previously and had intensities which were 100- to 1000-fold greater than the congeners of polybrominated diphenyl ethers (PBDEs). In extracts of sediments, these compounds exhibited variations in intensities (<10(3) to ∼10(8)), m/z values (170.9438-997.5217), retention times on a C18 column (1.0-29.3 min), and the number of Br atoms (1-8). Generally, compounds with greater m/z values had longer retention times and greater numbers of Br atoms. Three compounds were used in a proof-of-concept experiment to demonstrate that structures of some of the screened NSOBCs could be further predicted by combining searching of database libraries and high-resolution MS(2) spectra.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».