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Enregistrement W2478498099 · doi:10.1042/bcj20160531

The calcium-dependent protein kinase RcCDPK2 phosphorylates sucrose synthase at Ser11 in developing castor oil seeds

2016· article· en· W2478498099 sur OpenAlexaff
Eric T. Fedosejevs, Suzanne Gerdis, Sheng Ying, Michal Pyc, Erin M. Anderson, Wayne A. Snedden, Robert T. Mullen, Yi‐Min She, William C. Plaxton

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of GuelphQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryPhosphorylationBiologyCytosolDephosphorylationProtein kinase AKinaseSucrose synthaseSucroseCell biologyEnzymePhosphatase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Imported sucrose is cleaved by sucrose synthase (SUS) as a critical initial reaction in the biosynthesis of storage end-products by developing seeds. Although SUS is phosphorylated at a conserved seryl residue by an apparent CDPK (Ca2+-dependent protein kinase) in diverse plant tissues, the functions and mechanistic details of this process remain obscure. Thus, the native CDPK that phosphorylates RcSUS1 (Ricinus communis SUS1) at Ser11 in developing COS (castor oil seeds) was highly purified and identified as RcCDPK2 by MS/MS. Purified RcSUS1-K (-kinase) and heterologously expressed RcCDPK2 catalyzed Ca2+-dependent Ser11 phosphorylation of RcSUS1 and its corresponding dephosphopeptide, while exhibiting a high affinity for free Ca2+ ions [K0.5(Ca2+) < 0.4 µM]. RcSUS1-K activity, RcCDPK2 expression, and RcSUS1 Ser11 phosphorylation peaked during early COS development and then declined in parallel. The elimination of sucrose import via fruit excision triggered RcSUS1 dephosphorylation but did not alter RcSUS1-K activity, suggesting a link between sucrose signaling and posttranslational RcCDPK2 control. Both RcCDPK2-mCherry and RcSUS1-EYFP co-localized throughout the cytosol when transiently co-expressed in tobacco suspension cells, although RcCDPK2-mCherry was also partially localized to the nucleus. Subcellular fractionation revealed that ∼20% of RcSUS1-K activity associates with microsomal membranes in developing COS, as does RcSUS1. In contrast with RcCDPK1, which catalyzes inhibitory phosphorylation of COS bacterial-type phosphoenolpyruvate carboxylase at Ser451, RcCDPK2 exhibited broad substrate specificity, a wide pH–activity profile centered at pH 8.5, and insensitivity to metabolite effectors or thiol redox status. Our combined results indicate a possible link between cytosolic Ca2+-signaling and the control of photosynthate partitioning during COS development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,191
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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