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Enregistrement W2478627897 · doi:10.1074/jbc.m116.742056

The Receptor Site and Mechanism of Action of Sodium Channel Blocker Insecticides

2016· article· en· W2478627897 sur OpenAlexafffund
Yongqiang Zhang, Yuzhe Du, Dingxin Jiang, Caitlyn Behnke, Yoshiko Nomura, Boris S. Zhorov, Ke Dong

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSmithsonian Conservation Biology Institute
Mots-clésIndoxacarbChemistrySodium channelIon channelSodium channel blockerSodiumBiophysicsStereochemistryBiochemistryReceptorBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sodium channels are excellent targets of both natural and synthetic insecticides with high insect selectivity. Indoxacarb, its active metabolite DCJW, and metaflumizone (MFZ) belong to a relatively new class of sodium channel blocker insecticides (SCBIs) with a mode of action distinct from all other sodium channel-targeting insecticides, including pyrethroids. Electroneutral SCBIs preferably bind to and trap sodium channels in the inactivated state, a mechanism similar to that of cationic local anesthetics. Previous studies identified several SCBI-sensing residues that face the inner pore of sodium channels. However, the receptor site of SCBIs, their atomic mechanisms, and the cause of selective toxicity of MFZ remain elusive. Here, we have built a homology model of the open-state cockroach sodium channel BgNav1-1a. Our computations predicted that SCBIs bind in the inner pore, interact with a sodium ion at the focus of P1 helices, and extend their aromatic moiety into the III/IV domain interface (fenestration). Using model-driven mutagenesis and electrophysiology, we identified five new SCBI-sensing residues, including insect-specific residues. Our study proposes the first three-dimensional models of channel-bound SCBIs, sheds light on the molecular basis of MFZ selective toxicity, and suggests that a sodium ion located in the inner pore contributes to the receptor site for electroneutral SCBIs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,142

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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