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Enregistrement W2482446043 · doi:10.1186/s12870-016-0822-4

Single and multiple resistance QTL delay symptom appearance and slow down root colonization by Aphanomyces euteiches in pea near isogenic lines

2016· article· en· W2482446043 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesRégion BretagneConseil Régional de BretagneInstitut National de la Recherche AgronomiqueAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésBiologyColonizationResistance (ecology)Quantitative trait locusHorticultureAgronomyMicrobiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Understanding the effects of resistance QTL on pathogen development cycle is an important issue for the creation of QTL combination strategies to durably increase disease resistance in plants. The oomycete pathogen Aphanomyces euteiches, causing root rot disease, is one of the major factors limiting the pea crop in the main producing countries. No commercial resistant varieties are currently available in Europe. Resistance alleles at seven main QTL were recently identified and introgressed into pea agronomic lines, resulting in the creation of Near Isogenic Lines (NILs) at the QTL. This study aimed to determine the effect of main A. euteiches resistance QTL in NILs on different steps of the pathogen life cycle. RESULTS: NILs carrying resistance alleles at main QTL in susceptible genetic backgrounds were evaluated in a destructive test under controlled conditions. The development of root rot disease severity and pathogen DNA levels in the roots was measured during ten days after inoculation. Significant effects of several resistance alleles at the two major QTL Ae-Ps7.6 and Ae-Ps4.5 were observed on symptom appearance and root colonization by A. euteiches. Some resistance alleles at three other minor-effect QTL (Ae-Ps2.2, Ae-Ps3.1 and Ae-Ps5.1) significantly decreased root colonization. The combination of resistance alleles at two or three QTL including the major QTL Ae-Ps7.6 (Ae-Ps5.1/Ae-Ps7.6 or Ae-Ps2.2/Ae-Ps3.1/Ae-Ps7.6) had an increased effect on delaying symptom appearance and/or slowing down root colonization by A. euteiches and on plant resistance levels, compared to the effects of individual or no resistance alleles. CONCLUSIONS: This study demonstrated the effects of single or multiple resistance QTL on delaying symptom appearance and/or slowing down colonization by A. euteiches in pea roots, using original plant material and a precise pathogen quantification method. Our findings suggest that single resistance QTL can act on multiple or specific steps of the disease development cycle and that their actions could be pyramided to increase partial resistance in future pea varieties. Further studies are needed to investigate QTL effects on different steps of the pathogen life cycle, as well as the efficiency and durability of pyramiding strategies using QTL which appear to act on the same stage of the pathogen cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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