BRAF, PIK3CA, and PTEN status and benefit from cetuximab (CET) in the treatment of advanced colorectal cancer (CRC): Results from NCIC CTG/AGITG CO.17.
Notice bibliographique
Résumé
3515 Background: CET, a monoclonal antibody targeting the epidermal growth factor receptor, improves overall survival (OS) and progression free survival (PFS) in patients (pts) with KRAS wild-type (WT) chemotherapy refractory CRC. BRAF and PIK3CA mutation status, and PTEN expression levels may further predict benefit from CET therapy. Methods: Available colorectal tumour samples were analyzed from a phase III trial of CET plus best supportive care (BSC) vs BSC alone (NEJM 2007; 357(20)). BRAF and PIK3CA mutations (MUT) identified in tumour-derived DNA using a high resolution melting analysis to identify amplicons with mutations were confirmed by sequencing. PTEN expression by immunohistochemistry (IHC) was performed on tissue microarrays constructed from available tumour blocks. For each biomarker, prognostic (treatment independent) effects were assessed in patients on the BSC alone arm. Predictive effects (benefit from CET) on OS and PFS among all patients and those in the KRAS wild-type subset were examined using a Cox model with tests for treatment-biomarker interaction, adjusting for covariates. Results: Of 401 pts assessed for BRAF status (70% of CO17 population), 13(3%) had mutations. Of 407 pts assessed for PIK3CA status (71% of CO17 population), 61(15%) had mutations. Of 205 pts assessed for PTEN (36% of CO17 population), 148(72%) were negative for IHC expression. No biomarker was prognostic for OS or PFS, and none were predictive of benefit from CET, either in the whole study population or the KRAS WT subset. Conclusions: In chemotherapy-refractory CRC, neither PIK3CA mutation status nor PTEN expression were predictive of benefit from CET therapy. BRAF mutations are uncommon in this setting. Larger sample sizes would be required to determine if BRAF status is predictive for CET benefit. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».