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Enregistrement W2482949327 · doi:10.1007/978-1-60761-953-6_2

Videograms: A Method for Repeatable Unbiased Quantitative Behavioral Analysis Without Scoring or Tracking

2010· book-chapter· en· W2482949327 sur OpenAlexaff
Russell C. Wyeth, Oliver Braubach, Alan Fine, Roger P. Croll

Notice bibliographique

RevueNeuromethods · 2010
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensDalhousie UniversitySt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceTracking (education)Artificial intelligenceComputer visionMeasure (data warehouse)Pattern recognition (psychology)Data miningPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We present a method that complements both scoring by observers and automated tracking methods for quantifying behaviors. Based on standard motion enhancement, our algorithm converts a behavioral video recording into a single image (‘videogram’) that maps the spatial distribution of activity in the video sequence. This videogram can be used as a visual summary of activity and also as a direct, repeatable, and unbiased measure of animal activity. We describe the algorithm, and then use videograms to show acquisition of odorant-dependent place-conditioning in zebrafish trained in groups. We also demonstrate its potential for determining depth preferences and swimming speeds. This method generates activity measurements suitable for continuous variable statistics, and can be considered as an analysis alternative to behavioral tracking (over which it can have several advantages) for experiments not requiring exact trajectories.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,819
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,125
Tête enseignante GPT0,467
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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