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Enregistrement W2483040762 · doi:10.1111/zph.12296

Spatial Clustering of <i>Escherichia coli</i> with Reduced Susceptibility to Cefotaxime and Ciprofloxacin among Dairy Cattle Farms Relative to European Starling Night Roosts

2016· article· en· W2483040762 sur OpenAlexaff
Genet A. Medhanie, David L. Pearl, Scott A. McEwen, Michele T. Guerin, Claire M. Jardine, Jennifer Schrock, Jeffrey T. LeJeune

Notice bibliographique

RevueZoonoses and Public Health · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésCefotaximeCiprofloxacinVeterinary medicineBiologyEscherichia coliLivestockMicrobiologyAntibioticsEcologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

European starlings (Sturnus vulgaris) have been implicated in the dispersal of zoonotic enteric pathogens. However, their role in disseminating antimicrobial-resistant organisms through their home range has not been clearly established. The aim of this study was to determine whether starling night roosts served as foci for spreading organisms with reduced susceptibility to antimicrobials among dairy cattle farms. Bovine faecal pats were collected from 150 dairy farms in Ohio. Each farm was visited twice (in summer and fall) between 2007 and 2009. A total of 1490 samples (10 samples/farm over two visits) were tested for Escherichia coli with reduced susceptibility to cefotaxime and ciprofloxacin. Using a spatial scan statistic, focal scans were conducted to determine whether clusters of farms with a high prevalence of organisms with reduced susceptibility to cefotaxime and ciprofloxacin surrounded starling night roosts. Faecal pats 13.42% and 13.56% of samples carried Escherichia coli with reduced susceptibility to cefotaxime and ciprofloxacin, respectively. Statistically significant (P < 0.05) spatial clusters of faecal pats with high prevalence of Escherichia coli showing reduced susceptibility to cefotaxime and ciprofloxacin were identified around these night roosts. This finding suggests that the risk of carriage of organisms with reduced susceptibility to antimicrobials in cattle closer to starling night roosts was higher compared to cattle located on farms further from these sites. Starlings might have an important role in spreading antimicrobial-resistant E. coli to livestock environments, thus posing a threat to animal and public health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,819
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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