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Enregistrement W2484020400 · doi:10.1007/978-1-62703-266-7_7

Proteomic Approaches for the Study of Electrical Synapses and Associated Protein-Interaction Complexes

2012· book-chapter· en· W2484020400 sur OpenAlexaff
Cantas Alev, Georg Zoidl, Rolf Dermietzel

Notice bibliographique

RevueNeuromethods · 2012
Typebook-chapter
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroscienceComputational biologyProtein–protein interactionChemistryComputer scienceBiophysicsBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent advances in the identification and analysis of protein–protein interaction complexes associated with synapses and synaptic proteins deepened not only our insights into the molecular composition and dynamic structural makeup of interneuronal connections but contributed also significantly to our understanding of the molecular and mechanistic aspects underlying functional plasticity in neuronal networks. In particular proteome analytical tools, combining traditional isolation protocols with modern mass spectrometric approaches, were utilized successfully for the molecular analysis of chemical synapses and other neuronal subcellular structures revealing new and exciting insights into the temporal and spatial changes of the proteins composing or associated with for example synaptic vesicles, synaptic membranes, or postsynaptic densities (PSDs). Proteomic approaches may thus offer also a chance to gain valuable insights into the so far elusive molecular composition of electrical synapses, the Cinderella fated and long neglected little brethren of “classical” chemical synapses. In this chapter we provide an experimental basis of how such an analysis can be designed, with a major focus on the most abundant electrical synapse protein, connexin36.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,311
Score d'incertitude au seuil0,901

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
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