Abstract 5031: Melanoma progression involves a profound nuclear to cytoplasmic shift of the transcription factor SUM-6 (specifically upregulated in melanoma gene six)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract INTRODUCTION: SUM-6 is a human homeobox gene that encodes for a transcription factor, which plays a key role in normal embryogenesis. Overexpression of both the gene and nuclear protein has been shown to occur in a variety of cancers such as breast, colorectal, and pancreatic, and has been demonstrated to promote tumorigenesis. The purpose of the current study was to evaluate the expression of the SUM-6 protein, its clinical relevance, and biological function in melanoma. EXPERIMENTAL PROCEDURES: Immunohistochemistry using a specific SUM-6 antibody was performed on a tissue microarray consisting of 438 patient biopsies, which included benign and malignant melanocytic tumors. Double-blinded scoring of distinct nuclear and cytoplasmic SUM-6 staining was performed. SPSS 16.0 statistical package and Microsoft Excel were used to carry out the analyses of data. Analyses included the χ2 test and univariate analysis by the log-rank test in conjunction with the Kaplan-Meier survival curve for visualization. RESULTS: Nuclear staining of SUM-6 was detected in 100% of normal nevi (n = 19), 81% of dysplastic nevi (n = 32), 87% of melanoma in situ (n = 23), 79% of primary melanoma (n = 219), and 53% of metastatic melanoma (n = 145), whereas cytoplasmic staining was detected in 63%, 94%, 56%, 94%, and 97%, respectively. Univariate analysis revealed that five year disease-specific survival decreased significantly when SUM-6 was excluded from the nucleus and when SUM-6 levels were elevated in the cytoplasm (p = 0.001 and 0.019, respectively). CONCLUSIONS: We concluded that melanoma progression and metastasis is associated with a profound shift of transcription factor SUM-6 from the nucleus to the cytoplasm. It is interesting to note that in most other cancers, the SUM-6 protein was instead overexpressed in the nucleus. The patients in whom SUM-6 was excluded from the nucleus demonstrated a significantly worse prognosis than the patients who retained nuclear expression. These findings suggest that either the absence of nuclear expression or elevated cytoplasmic presence (or both) of SUM-6 may play a role in the progression of malignant melanoma. Citation Format: Laura J. Graziano, Xue Zhang, Yabin Cheng, Gang Wang, Mingwan Su, Magdalena Martinka, Youwen Zhou. Melanoma progression involves a profound nuclear to cytoplasmic shift of the transcription factor SUM-6 (specifically upregulated in melanoma gene six). [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 5031.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».