Development of a Fluorescent Multiwell Assay for Evaluating the Capacity of the Ciliated Protozoan Tetrahymena for Bacterivory in Water Samples
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bacterivory by ciliates in various water ecosystems, both natural and artificial, plays a significant role on the microbial population composition and consequently affects water quality. A convenient, rapid and inexpensive methodology to evaluate the capacity of the ciliate protozoan Tetrahymena thermophila for bacterivory was developed utilizing fluorescent protein expressing bacteria (FPEB) in a microtitre plate fluorimeter. Bacterivory was correlated with a loss in fluorescence measured in the fluorimeter and confirmed by fluorescence microscopy showing that the FPEB were engulfed during the assay and subsequently lost their fluorescence, whereas Cytochalasin B, a known inhibitor of phagocytosis, prevented a decrease in relative fluorescence units (RFUs). The ciliate bacterivory (CB) assay has a great dynamic range allowing the assay to be performed with a variety of predator:prey concentrations. A model toxicant, CuCl2, known to have a toxicological impact on protozoa and often present in different types of wastewater, resulted in measurable decreases in bacterivory. As well, starvation of Tetrahymena for 24 h resulted in reduced bacterivory. In the future, the CB assay could be developed for water monitoring purposes to rapidly assess water samples for the capacity to support bacterivory as an indicator of ecosystem health.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».