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Enregistrement W2488542541 · doi:10.1111/ejn.13351

Age‐dependent increase in Kalirin‐9 and Kalirin‐12 transcripts in human orbitofrontal cortex

2016· article· en· W2488542541 sur OpenAlexaff
Melanie Grubisha, Chien‐Wei Lin, George C. Tseng, Peter Penzes, Etienne Sibille, Robert A. Sweet

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neuroscience · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensMental Health Research CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingNational Institutes of HealthU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésGene isoformExonHuman brainChemistryActin cytoskeletonAlternative splicingPhenotypeGeneCytoskeletonNeuroscienceBiologyBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

KALRN (KAL) is a Rho GEF that is highly involved in regulation of the actin cytoskeleton within dendrites. There are several isoforms of the protein that arise from differential splicing of KALRN's 66 exons. KAL isoforms have different functions in development. For example, overexpression of the KAL9 and KAL12 isoforms induce dendritic elongation in early development. However, in mature neurons KAL9 overexpression reduces dendritic length, a phenotype also observed in normal human ageing. We therefore hypothesized that KAL9 would have increased expression with age, and undertook to evaluate the expression of individual KALRN exons throughout the adult lifespan. Postmortem human brain grey matter from Brodmann's area (BA) 11 and BA47 derived from a cohort of 209 individuals without psychiatric or neurodegenerative disease, ranging in age from 16 to 91 years, were analysed for KALRN expression by Affymetrix exon array. Analysis of the exon array data in an isoform-specific manner, as well as confirmatory isoform-specific qPCR studies, indicated that the longer KAL9 and KAL12 isoforms demonstrated a statistically significant, but modest, increase with age. The small magnitude of the age effect suggests that inter-individual factors other than age likely contribute to a higher degree to KAL9 and KAL12 expression. In contrast to KAL9 and KAL12, global KALRN expression did not increase with age. Our work suggests that global measures of KALRN gene expression may be misleading and future studies should focus on isoform-specific quantification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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