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Enregistrement W2490577887 · doi:10.1534/g3.116.032664

A Genetic Screen for Fission Yeast Gene Deletion Mutants Exhibiting Hypersensitivity to Latrunculin A

2016· article· en· W2490577887 sur OpenAlexafffund
Farzad Asadi, Dorothy Michalski, Jim Karagiannis

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCytokinesisCell biologySeptinBiologyCell divisionMitosisSchizosaccharomyces pombeGeneticsCytoskeletonMutantGenetic screenGeneActin cytoskeletonCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fission yeast cells treated with low doses of the actin depolymerizing drug, latrunculin A (LatA), delay entry into mitosis via a mechanism that is dependent on both the Clp1p and Rad24p proteins. During this delay, cells remain in a cytokinesis-competent state that is characterized by continuous repair and/or reestablishment of the actomyosin ring. In this manner, cells ensure the faithful completion of the preceding cytokinesis in response to perturbation of the cell division machinery. To uncover other genes with a role in this response, or simply genes with roles in adapting to LatA-induced stress, we carried out a genome-wide screen and identified a group of 38 gene deletion mutants that are hyper-sensitive to the drug. As expected, we found genes affecting cytokinesis and/or the actin cytoskeleton within this set (ain1, acp2, imp2). We also identified genes with roles in histone modification (tra1, ngg1), intracellular transport (apl5, aps3), and glucose-mediated signaling (git3, git5, git11, pka1, cgs2). Importantly, while the identified gene deletion mutants are prone to cytokinesis failure in the presence of LatA, they are nevertheless fully capable of cell division in the absence of the drug. These results indicate that fission yeast cells make use of a diverse set of regulatory modules to counter abnormal cytoskeletal perturbations, and furthermore, that these modules act redundantly to ensure cell survival and proliferation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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