Comparative Analysis of Deoxynivalenol Biosynthesis Related Gene Expression among Different Chemotypes of Fusarium graminearum in Spring Wheat
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium mycotoxins, deoxynivalenol (DON) and nivalenol (NIV) act as virulence factors and are essential for symptom development after initial infection in wheat. To date, 16 genes have been identified in the DON biosynthesis pathway. However, a comparative gene expression analysis in different chemotypes of Fusarium graminearum in response to Fusarium head blight infection remains to be explored. Therefore, in this study, nine genes that involved in trichothecene biosynthesis were analyzed among 3-acetyldeoxynivalenol (3-ADON), 15-acetyldeoxynivalenol (15-ADON) and nivalenol producing F. graminearum strains in a time course study. Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction revealed that the expression of all examined TRI gene transcripts initiated at 2 days post-inoculation (dpi), peaked at three to four dpi and gradually decreased at seven dpi. The early induction of TRI genes indicates that presence of high levels of TRI gene transcripts at early stages is important to initiate the biosynthetic pathway of DON and NIV. Comparison of gene expression among the three chemotypes showed that relative expression of TRI genes was higher in 3-ADON producing strains compared with 15-ADON and NIV strains. Comparatively higher levels of gene expression may contribute to the higher levels of DON produced by 3-ADON strains in infected grains.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».