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Enregistrement W2491730605 · doi:10.1098/rsob.160082

Characterization of DicB by partially masking its potent inhibitory activity of cell division

2016· article· en· W2491730605 sur OpenAlexafffund
Shaoyuan Yang, Hairun Pei, Xiaoying Zhang, Qiang Wei, Jia Zhu, Jimin Zheng, Zongchao Jia

Notice bibliographique

RevueOpen Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyInhibitory postsynaptic potentialMasking (illustration)Cell divisionDivision (mathematics)CellCell biologyGeneticsComputational biologyNeuroscienceArithmetic

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DicB, a protein encoded by the Kim (Qin) prophage in Escherichia coli, inhibits cell division through interaction with MinC. Thus far, characterization of DicB has been severely hampered owing to its potent activity which ceases cell division and leads to cell death. In this work, through fusing maltose-binding protein to the N-terminus of DicB (MBP-DicB), we successfully expressed and purified recombinant DicB that enabled in vitro analysis for the first time. More importantly, taking advantage of the reduced inhibitory activity of MBP-DicB, we were able to study its effects on cell growth and morphology. Inhibition of cell growth by MBP-DicB was systematically evaluated using various DicB constructs, and their corresponding effects on cell morphology were also investigated. Our results revealed that the N-terminal segment of DicB plays an essential functional role, in contrast to its C-terminal tail. The N-terminus of DicB is of critical importance as even the first amino acid (following the initial Met) could not be removed, although it could be mutated. This study provides the first glimpse of the molecular determinants underlying DicB's function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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