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Enregistrement W2492058774 · doi:10.1017/cbo9781139627085.008

Infectious disease and the conservation of freshwater fish

2015· book-chapter· en· W2492058774 sur OpenAlexaff
Martin Krkošek, Robert Poulin

Notice bibliographique

RevueCambridge University Press eBooks · 2015
Typebook-chapter
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFreshwater fishFreshwater ecosystemHabitatEcologyHabitat fragmentationBiologyConservation biologyClimate changeGeographyFish <Actinopterygii>EcosystemFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION Infectious diseases may be an important component of the conservation of freshwater fish. Rates of infectious diseases in freshwater fish are increasing (Johnson & Paull, 2011), and are likely a consequence of the multiple anthropogenic effects that are making freshwater systems the most degraded ecosystems on Earth (Carpenter et al ., 2011). More broadly, emerging diseases across taxa from all habitats tend to be related to environmental changes such as habitat fragmentation, species translocations/invasions, altered food webs, climate change or pollution (Daszak et al ., 2000; Dobson & Foufopoulos, 2001; Kelly et al ., 2009b). Similar processes may be at play in freshwater systems; however, these systems have received comparatively less attention than their terrestrial and marine counterparts (Johnson & Paull, 2011). However, the role of infectious disease in species endangerment and extinction is complex and debatable (Lafferty & Gerber, 2002), and so it is not immediately clear if increasing rates of disease imply that disease is a threat to the conservation of freshwater fish. The primary reason for this is that transmission efficiency of many pathogens is linked to the density of hosts, and so when hosts become rare, it is expected that diseases will fade out and therefore may not necessarily cause extinction of their host (Grenfell & Dobson, 1995; Hudson et al ., 2001). Indeed, a parasite that eliminates its host population also reduces its own fitness to zero, and so it is not clear if diseases are a direct threat to species persistence. Furthermore, fishes have a common life-history characteristic of relatively high fecundity (egg output) but relatively low survival from egg through to reproductive maturity. Such high mortality within the life cycle is often associated with non-disease related factors such as predation. This leads to potentially complex dynamics (Hatcher et al ., 2012) where different mortality processes may interact in compensatory or synergistic ways. For example, if most juvenile fish will die anyway due to predation, does an increase in infection level correspond to an increase in overall mortality? If predators selectively remove infected prey, this may actually counteract disease mortality and lead to healthier populations or alternatively by making prey easier to capture may increase overall mortality (Packer et al ., 2003; Krkošek et al ., 2011a). Such complex ecological dynamics entangle predator–prey, competition, and host–parasite relationships and can thus lead to multiple mortality processes that may exacerbate or dampen the effects of disease on host populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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