Spatial patterns of immunogenetic and neutral variation underscore the conservation value of small, isolated American badger populations
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Small and isolated populations often exhibit low genetic diversity due to drift and inbreeding, but may simultaneously harbour adaptive variation. We investigate spatial distributions of immunogenetic variation in American badger subspecies (Taxidea taxus), as a proxy for evaluating their evolutionary potential across the northern extent of the species’ range. We compared genetic structure of 20 microsatellites and the major histocompatibility complex (MHC DRB exon 2) to evaluate whether small, isolated populations show low adaptive polymorphism relative to large and well‐connected populations. Our results suggest that gene flow plays a prominent role in shaping MHC polymorphism across large spatial scales, while the interplay between gene flow and selection was stronger towards the northern peripheries. The similarity of MHC alleles within subspecies relative to their neutral genetic differentiation suggests that adaptive divergence among subspecies can be maintained despite ongoing gene flow along subspecies boundaries. Neutral genetic diversity was low in small relative to large populations, but MHC diversity within individuals was high in small populations. Despite reduced neutral genetic variation, small and isolated populations harbour functional variation that likely contribute to the species evolutionary potential at the northern range. Our findings suggest that conservation approaches should focus on managing adaptive variation across the species range rather than protecting subspecies per se.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».