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Enregistrement W2492371880

Functional analysis of adapter protein c-Abl Src homology 3 domain-binding protein 2.

2009· dissertation· en· W2492371880 sur OpenAlexvenueno aff
Grace Yi-Ying Chen

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Myeloid Leukemia Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSH3 domainProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcSignal transducing adaptor proteinAdapter (computing)ABLComputational biologyHomology (biology)BiologyCell biologyChemistryComputer scienceGeneticsSignal transductionTyrosine kinaseOperating systemGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

3BP2 is a pleckstrin homology (PH) domain- and Src homology 2 (SH2) domain-containing adapter protein that has been linked through genetic evidence to a rare human disease called cherubism 146. 3BP2 was originally cloned in a screen to identify c-Abl SH3 binding proteins 23,24. In overexpression studies, 3BP2 has been implicated as a positive regulatory adapter molecule coupled to immunoreceptor on T cells 67,69,70, B cells 68, NK cells 71-73 and mast cells 74,75. It was also evident that 3BP2 forms complexes with a number of signaling molecules, such as Zap-70, LAT, phospholipase C-γ1 (PLC-γ1), Grb2, Cbl, and Fyn in Jurkat cells 67 and Vav1, Vav2, PLC-γ, and Syk in Daudi B cells 68. Despite the growing body of biochemical data to support the importance of 3BP2 in cells of the hematopoietic lineage, a clear picture of the biological function of 3BP2 has yet to emerge. To elucidate the in vivo function of 3BP2, our laboratory has generated 3BP2 gene-deficient mice through homologous recombination 452. The 3BP2-deficient (3BP2-/-) mice were born at the expected Mendelian frequency and were fertile and viable. 3BP2-/- mice accumulate splenic marginal-zone (MZ) B cells, possess a reduced frequency of peritoneal B-1 B cells, and have a diminished thymus-independent type 2 (TI-2) antigen response. 3BP2-/- B cells demonstrate diminished proliferation and cell survival following cross-linking of the B-cell receptor (BCR). Following BCR ligation, 3BP2 might be recruited to BCR complex through its inducible interaction with BCR costimulatory molecule CD19. In the absence of 3BP2, the activation of BCR downstream effectors such as MAPK Erk1/2, JNK, and c-Abl is normal; however, 3BP2 deficiency leads to defects in Syk phosphorylation and calcium flux. In addition to defects in peripheral B cell activities, 3BP2 deficiency contributes to defects in neutrophil activities. In response to the chemotactic peptide, fMLF, 3BP2-/- neutrophils fail to establish directional migration in vitro. There is a defect in the accumulation of filamentous actin at the leading edge of migrating 3BP2-/- neutrophils which might be responsible for the random movement of these cells under shallow gradient of fMLF. In vivo, there is a delay in the recruitment of circulating neutrophils to the site of chemically induced inflammation in 3BP2-/- mice. Compared to wildtype neutrophils, 3BP2-/- neutrophils fail to properly produce superoxide anion (O2-) following fMLF stimulation. Defects in both directional migration and superoxide production of 3BP2-/- neutrophils might contribute to the reduction in bacteria clearance and the increased mortality in 3BP2-/- mice post Listeria Monocytogenes infection. In Chapter 1 of this thesis, I have reviewed basic structures and functions of the domain modules found in adapter proteins. In addition, I have reviewed the findings from numerous reports on the function of 3BP2 in different cell types. A discussion of the physical appearance and some of the initial characterization of 3BP2-deficient mice (3BP2-/-) we have generated in our laboratory are included in Chapter 1. The second part of Chapter 1 consists of an introduction on B cell receptor signaling pathway and B-cell development and activation. A discussion of G protein-coupled receptor-mediated neutrophil functions can also be found in Chapter 1. Chapter 2 contains all the methods and materials used in my study. Chapter 3 includes the characterization of peripheral B cell compartment of 3BP2-/- mice as well as the role of 3BP2 downstream of B-cell antigen receptor and in T-independent immune response. In chapter 4, I present data from experiments designed to examine the role of 3BP2 downstream of a G protein-coupled receptor, fMLF receptor, of neutrophils. I also show the requirement of 3BP2 in the clearance of Listeria Monocytogenes. In chapter 5, I propose two models for 3BP2 action based on the findings in B cells and neutrophils and discuss future areas for investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,171
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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