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Enregistrement W2493687124 · doi:10.1002/gcc.22398

Heterogeneity of <i>MYCN</i> amplification in neuroblastoma at diagnosis, treatment, relapse, and metastasis

2016· article· en· W2493687124 sur OpenAlexaff
Paula Marrano, Meredith S. Irwin, Paul S. Thorner

Notice bibliographique

RevueGenes Chromosomes and Cancer · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroblastomaHistologyClinical significanceGene duplicationCopy-number variationCancer researchFluorescence in situ hybridizationMetastasisN-MycMedicinePathologyBiologyCancerGeneInternal medicineGenomeGeneticsCell cultureGanglioneuroma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amplification of the MYCN gene in neuroblastoma is associated with a poor prognosis and is considered to remain unchanged in post-treatment specimens and metastases. While heterogeneity of MYCN copy number in tumor cells has been reported, serial samples have only been studied in a limited way, and the biologic relevance of this finding is not well understood. We used in situ hybridization on paraffin sections of 102 specimens from 30 patients with MYCN-amplified neuroblastoma to determine MYCN copy number in the primary tumor, pre- and post-treatment, and in metastatic samples. Nineteen cases (63%) showed diffuse MYCN amplification in all samples tested. Nine cases (30%) showed a reduction in MYCN copy number: five cases with diffuse amplification subsequently showed focal amplification, one case with diffuse MYCN amplification showed MYCN gain after treatment, and three focally amplified cases were non-amplified in later specimens. In two cases (7%), focal amplification became diffuse in subsequent samples. Histology was not predictive of the temporal or spatial pattern of MYCN amplification for a particular tumor. If extent of amplification (focal vs. diffuse) is not considered, 26/30 (87%) of cases were consistently MYCN-amplified. However, our data suggest that MYCN status can be heterogeneous between tumor sites, during tumor progression or following treatment, challenging the notion that MYCN copy number does not change for a particular neuroblastoma. Assessing the biologic significance of MYCN heterogeneity will require larger studies of clinically annotated tumor samples, and will depend on interpreting heterogeneity in MYCN status in combination with other genetic changes. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,330
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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