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Enregistrement W2493891178 · doi:10.1085/jgp.201611614

Biophysical characterization of the honeybee DSC1 orthologue reveals a novel voltage-dependent Ca2+ channel subfamily: CaV4

2016· article· en· W2493891178 sur OpenAlexafffund
Pascal Gosselin‐Badaroudine, Adrien Moreau, Louis Simard, Thierry Cens, Matthieu Rousset, Claude Collet, Pierre Charnet, Mohamed Chahine

Notice bibliographique

RevueThe Journal of General Physiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect and Pesticide Research
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésXenopusBiologySubfamilyBiophysicsIon channelHeterologous expressionSelectivityBiochemistryMembrane potentialReversal potentialChemistryPatch clampGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bilaterian voltage-gated Na(+) channels (NaV) evolved from voltage-gated Ca(2+) channels (CaV). The Drosophila melanogaster Na(+) channel 1 (DSC1), which features a D-E-E-A selectivity filter sequence that is intermediate between CaV and NaV channels, is evidence of this evolution. Phylogenetic analysis has classified DSC1 as a Ca(2+)-permeable Na(+) channel belonging to the NaV2 family because of its sequence similarity with NaV channels. This is despite insect NaV2 channels (DSC1 and its orthologue in Blatella germanica, BSC1) being more permeable to Ca(2+) than Na(+) In this study, we report the cloning and molecular characterization of the honeybee (Apis mellifera) DSC1 orthologue. We reveal several sequence variations caused by alternative splicing, RNA editing, and genomic variations. Using the Xenopus oocyte heterologous expression system and the two-microelectrode voltage-clamp technique, we find that the channel exhibits slow activation and inactivation kinetics, insensitivity to tetrodotoxin, and block by Cd(2+) and Zn(2+) These characteristics are reminiscent of CaV channels. We also show a strong selectivity for Ca(2+) and Ba(2+) ions, marginal permeability to Li(+), and impermeability to Mg(2+) and Na(+) ions. Based on current ion channel nomenclature, the D-E-E-A selectivity filter, and the properties we have uncovered, we propose that DSC1 homologues should be classified as CaV4 rather than NaV2. Indeed, channels that contain the D-E-E-A selectivity sequence are likely to feature the same properties as the honeybee's channel, namely slow activation and inactivation kinetics and strong selectivity for Ca(2+) ions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,745
Score d'incertitude au seuil0,137

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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