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Enregistrement W2495604699 · doi:10.21273/hortsci.50.3.341

Screening Carrot Germplasm for Resistance to Xanthomonas hortorum pv. carotae

2015· article· en· W2495604699 sur OpenAlexaff
Charles E. Christianson, Stephen S. Jones, Lindsey J. du Toit

Notice bibliographique

RevueHortScience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensHatch (Canada)
Organismes subventionnairesBayer CropScienceU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBiologyDaucus carotaGermplasmInoculationPopulationHorticultureCultivarErwiniaBlightXanthomonas campestrisXanthomonasBotanyVeterinary medicineBacteriaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xanthomonas hortorum pv. carotae ( Xhc ) causes bacterial blight of carrot ( Daucus carota L.), is endemic in the primary regions of carrot seed production, and is readily seed-transmitted. Genetic resistance to Xhc is not well documented in commercially available carrot cultivars, and there has been little public research on screening for resistance. Carrot PI lines (n = 66), public inbred lines (n = 2), and commercial cultivars (n = 17) were assessed for response to Xhc in a greenhouse in 2012 based on the incidence and severity of bacterial blight symptoms after inoculation as well as Xhc population [colony-forming units (CFU)/g dry foliage] detected by dilution plating onto XCS agar, a semiselective medium for Xhc . Severity of bacterial blight averaged 8.8% ± 0.4% (mean ± se ) with a range of 0% to 50%, and size of the Xhc population detected on the foliage averaged 8.16 × 10 9 ± 1.07 × 10 9 CFU/g (range, 1.38 × 10 4 to 3.28 × 10 11 CFU/g) for individual plants. Eight putative resistant PI lines and five highly susceptible PI lines selected from the 2012 screening were evaluated again in 2013 with an additional two PI lines, 12 cultivars, two inbred lines, and 12 carrot wild relatives. In the 2013 trial, severity of foliar blight 6 weeks post-inoculation ranged from 0% to 90% (11.8% ± 0.4%), and Xhc population ranged from 4.90 × 10 4 to 1.30 × 10 11 CFU/g dry foliage (1.00 × 10 10 ± 5.29 × 10 8 CFU/g) for individual plants. Spearman’s correlation coefficient between the Xhc population detected and severity of bacterial blight was highly significant in the 2012 and 2013 trials ( r = 0.52 and 0.62, respectively, at P < 0.0001). PI lines 418967, 432905, and 432906 were the most resistant based on Xhc population detected and could be used to develop resistant cultivars. Of the 12 carrot wild relatives screened, only Ames 7674 and SS10 OR displayed a relatively low severity of bacterial blight and population of Xhc on the foliage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,906
Score d'incertitude au seuil0,298

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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