Copy number alterations of <i>P53</i>, <i>RB1,</i> and <i>MDM2</i> as prognostic markers in intermediate-risk prostate cancer.
Notice bibliographique
Résumé
117 Background: We interrogated copy number alternations (CNA) of p53, Rb1 and MDM2 as prognostic determinants of biochemical failure in localized intermediate-risk prostate cancer. Methods: Using Affymetrix Oncoscan array technology, we characterized copy number alterations (CNA) for 284 D’Amico-classified intermediate-risk prostate cancers. Of the 284 patients, 143 underwent image-guided radiotherapy (IGRT), while 141 underwent radical prostatectomy (RadP). Biochemical-relapse free survival (bRFS) was assessed as a clinical end-point, with biochemical failure defined using the Phoenix and AUA criteria for IGRT and RadP patients, respectively. Results: We observed allelic losses ofp53 and Rb1 in 23.9% (n = 68) and 31.0% (n = 88) and allelic gains of MDM2 in 3.17% (n = 9) in our cohort, respectively. 7.7% (n = 22), 1.1% (n = 3) and 0.4% (n = 1) of all cases exhibited concurrent losses of p53 and Rb1, p53 loss and MDM2 gain, and concurrent p53/Rb1 loss and MDM2 gain, respectively. Patients with allelic losses of p53, Rb1 and allelic gain of MDM2 loci exhibited increased percent genome aberration (PGA) (Mean 9.2 vs. 6.1 p < 0.001; 10.1 vs. 5.4 p < 0.001; 18.1 vs. 6.5 p < 0.001 respectively). Rb1 loss and MDM2 gain were not significant predictors of bRFS, independent of treatment modality. Allelic loss of p53 was predictive of poor bRFS in the RadP cohort (HR = 1.86, 95% CI 1.10-3.16, p = 0.022), but not for IGRT patients (HR = 1.16, 95% CI 0.63-2.12, p = 0.629). Additionally, patients in the RadP cohort with concurrent losses of p53 and Rb1 also had a higher likelihood of poorer bRFS (HR = 2.32, 95% CI 1.1-4.93, p = 0.029). On multivariate analysis, incorporating PGA and pre-treatment PSA, concurrent p53/Rb1 losses, but not single p53 loss, was prognostic for bRFS in patients who underwent RadP (p53/Rb1 losses, HR = 2.16, 95% CI 1.0-4.65, Wald's p = 0.05; p53loss, HR = 1.62, 95% CI 0.94-2.79, Wald's p = 0.08). Conclusions: In a cohort of men with intermediate-risk prostate cancers, we identified an unfavourable subgroup of patients harbouring concurrent copy number losses of p53 and Rb1 that was associated with an adverse prognosis of biochemical failure following radical prostatectomy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».