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Enregistrement W2499454114 · doi:10.1158/1538-7445.am2015-3708

Abstract 3708: Filling the void of Canadian T-cell lymphoma epidemiology: Data from the canadian institute for health information discharge abstract database

2015· article· en· W2499454114 sur OpenAlexaffabout
Etienne Mahé, Trevor J. Pugh, Tracy Stockley, Suzanne Kamel‐Reid

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and Retrovirus Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidemiologyMedicinePopulationIncidence (geometry)DatabaseDemographyFamily medicineEnvironmental healthPathologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Epidemiological data for rare malignancies can be difficult to obtain; population-based data sets are often abridged to group disparate rare malignancies into larger more manageable clusters. These problems are acute in Canada, where such epidemiological data are often estimated from “second-hand” US data (e.g. Surveillance, Epidemiology and End-Results (SEER) data). Recently, the Canadian Institute of Health Information (CIHI) has set out to make epidemiological data more readily accessible, permitting University-affiliated researchers to access the anonymized and codified CIHI Discharge Abstract Database (DAD). Methods We undertook to estimate the incidence, demographics, and outcome data relating to the various subtypes of peripheral T-cell lymphomas (PTCLs) in Canada (excluding Quebec and British Columbia, for which data was not collected). The CIHI DAD consists of a two fiscal-year anonymized 10% random sample of all hospital discharge abstracts in Canada. The DAD is indexed by a unique anonymous patient identifiers and includes relative date metrics, by which all dates originally present on the abstract are standardized to a unique but confidential CIHI DAD reference date. From these data we were able to identify all hematolymphoid diagnoses, isolate the PTCLs, separate new from historical diagnoses, and identify patient age range, gender and disposition data. When the disposition data were combined with the relative date metrics, a gross estimate of T-cell lymphoma overall survival (relative to all other hematolymphoid diagnoses) was generated. Population normalization was achieved using inter-censal estimates obtained from Statistics Canada. Results PTCL incidence was estimated at 0.72 cases per 100,000 per annum (comparable to recently published SEER data). We also estimated a prevalence of 21 PTCLs per 100,000 healthcare encounters. Most cases of PTCL originated from males (63%) and the distribution of age ranges was skewed toward older adults (median age by number of cases = 60 years). The most frequent diagnosis was PTCL, NOS (46%). By the Cox-proportional hazards method, there was a statistically significant difference in survival between the T-cell lymphomas and non T-cell hematolymphoid malignancies (regression co-efficient for PTCL vs. non-PTCL diagnosis p = 0.003) in favor of the latter; not surprisingly, age was also predictive of overall survival, regardless of the subtype of malignancy (regression co-efficient p = 0.004). Conclusions To our knowledge, the above is the first attempt to estimate the epidemiology of PTCLs in Canada. In addition, we present a unique approach to obtaining high-quality (albeit geographically incomplete) Canadian epidemiological data via the CIHI DAD database; this dataset may serve as a valuable resource in the context of rare diseases whose epidemiological data may not be widely or publicly available. Citation Format: Etienne R. Mahe, Princess Margaret Cancer Centre Advanced MolecularDiagnostics Laboratory, Trevor Pugh, Tracy Stockley, Suzanne Kamel-Reid. Filling the void of Canadian T-cell lymphoma epidemiology: Data from the canadian institute for health information discharge abstract database. [abstract]. In: Proceedings of the 106th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2015 Apr 18-22; Philadelphia, PA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2015;75(15 Suppl):Abstract nr 3708. doi:10.1158/1538-7445.AM2015-3708

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,353
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,283
Tête enseignante GPT0,413
Écart entre enseignants0,130 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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