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Enregistrement W2500289352 · doi:10.1186/s13075-016-1070-6

The unfolded protein response genes in human osteoarthritic chondrocytes: PERK emerges as a potential therapeutic target

2016· article· en· W2500289352 sur OpenAlexaff
Yinghua Li, Ginette Tardif, David Hum, Mohit Kapoor, Hassan Fahmi, Jean‐Pierre Pelletier, Johanne Martel‐Pelletier

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensHôpital Saint-LucUniversity of TorontoUniversité de MontréalUniversity Health NetworkCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésUnfolded protein responseXBP1Downregulation and upregulationSmall interfering RNAGene silencingTunicamycinThapsigarginCell biologyGene expressionChondrocyteEndoplasmic reticulumCartilageChemistryCancer researchMedicineGeneBiologyRNAAnatomyRNA splicing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The unfolded protein response (UPR) is activated following an endoplasmic reticulum (ER) stress. The aim of this study was to investigate the global expression of UPR genes in human OA chondrocytes in induced (I)-UPR conditions, and to explore the regulation and role of the UPR genes in homeostatic (H)-UPR conditions in human normal and OA chondrocytes. METHODS: Gene expression was determined by PCR array and qPCR. Protein production in cartilage was determined by immunohistochemistry, gene silencing by specific siRNAs, and gene regulation by treating chondrocytes with cytokines and growth factors associated with cartilage pathobiology. RESULTS: Several UPR genes, among them ERN1, PERK, and CREB3L2 were downregulated in OA compared to normal chondrocytes at both the mRNA and protein levels, but the ER stress response triggered by thapsigargin or tunicamycin treatment was similar in normal and OA chondrocytes. The activation of ER stress sensors (phosphorylated PERK, cleavage of ATF6B, and the spliced mRNA forms of XBP1) was not significantly increased in OA chondrocytes/cartilage. PDGF-BB and IL-6 significantly downregulated the expression of ERN1, PERK, and CREB3L2, but not that of ATF6B. Silencing experiments done under conditions of no ER stress (physiological conditions) revealed that decreasing ERN1 expression led to decreased COL2a1, MMP-13, ADAMTS4 and ADAMTS5 expression, while decreasing CREB3L2 and ATF6B led to decreased ADAMTS5 and ADAMTS4 expression, respectively. Importantly, the downregulation of PERK expression increased COL1a1 and suppressed COL2a1 expression. CONCLUSIONS: Although the level of ER stress is not significantly increased in OA chondrocytes, these cells respond strongly to an acute ER stress despite the decreased expression of ERN1, PERK, and CREB3L2. Emerging findings revealed for the first time that these genes play a role in cartilage biology in conditions where an acute ER stress response is not triggered and OA is not characterized by an overall basal activation of the ER stress response. Importantly, these findings identify PERK as a potential target for new OA treatment avenues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,639

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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