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Enregistrement W2500441301 · doi:10.1186/s12916-016-0654-y

Major milestones in translational oncology

2016· editorial· en· W2500441301 sur OpenAlexaff
Tommaso A. Dragani, Antoni Castells, Vathany Kulasingam, Eleftherios P. Diamandis, Helena Earl, Wade T. Iams, Christine M. Lovly, J.P. Michiel Sedelaar, Jack A. Schalken

Notice bibliographique

RevueBMC Medicine · 2016
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIUniversitat de BarcelonaFundación Científica Asociación Española Contra el CáncerDamon Runyon Cancer Research FoundationLUNGevity FoundationGenentechAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroNational Cancer InstituteAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaNational Institutes of HealthMinisterio de Economía y Competitividad
Mots-clésMedicineTranslational researchLiquid biopsyColorectal cancerCancerProstate cancerOvarian cancerOncologyCarcinogenesisPrecision medicinePersonalized medicineTranslational medicineBioinformaticsInternal medicineBiomarker discoveryPathologyProteomicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translational oncology represents a bridge between basic research and clinical practice in cancer medicine. Today, translational research in oncology benefits from an abundance of knowledge resulting from genome-scale studies regarding the molecular pathways involved in tumorigenesis. In this Forum article, we highlight the state of the art of translational oncology in five major cancer types. We illustrate the use of molecular profiling to subtype colorectal cancer for both diagnosis and treatment, and summarize the results of a nationwide screening program for ovarian cancer based on detection of a tumor biomarker in serum. Additionally, we discuss how circulating tumor DNA can be assayed to safely monitor breast cancer over the course of treatment, and report on how therapy with immune checkpoint inhibitors is proving effective in advanced lung cancer. Finally, we summarize efforts to use molecular profiling of prostate cancer biopsy specimens to support treatment decisions. Despite encouraging early successes, we cannot disregard the complex genetics of individual susceptibility to cancer nor the enormous complexity of the somatic changes observed in tumors, which urge particular attention to the development of personalized therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,047
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,128

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,047
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0030,007
Communication savante0,0100,010
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0150,046
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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