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Enregistrement W2500702915 · doi:10.1158/1538-7445.am2016-1834

Abstract 1834: Semaphorin 3C is an androgen receptor-regulated gene

2016· article· en· W2500702915 sur OpenAlexaff
Kevin J. Tam, Kush Dalal, Michael Hsing, Chi Wing Cheng, Yan Ting Chiang, Aishwariya Sharma, James W. Peacock, Artem Cherkasov, Yuzhuo Wang, Martin Gleave, Paul S. Rennie, Christopher J. Ong

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAndrogen receptorProstate cancerBiologySemaphorinLNCaPTranscription factorCancer researchEnzalutamideCancerGeneticsCell biologyGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Prostate cancer (PCa) is the second leading cause of cancer-related deaths in North America. The androgen receptor (AR) is a member of the nuclear receptor superfamily of transcription factors and is heavily implicated in PCa progression. First-line therapies frequently target the AR axis and are initially met with favourable response but restored and aberrant AR signaling fuel disease progression to stages for which treatment is palliative. Transcriptional targets of the AR include genes involved in cell growth and cell fate but are not completely described. The semaphorin family of signaling proteins is a large grouping of cell-surface or secreted signaling proteins that function in neurogenesis and development. The roles of semaphorins in cancer are becoming increasingly evident however mechanistic details surrounding their involvement in cancer are poorly defined. One member of the class 3 semaphorins, SEMA3C, has been shown to confer invasive phenotypes in prostate cancer cells. Using the AR-positive LNCaP cell line we show that SEMA3C is an androgen-responsive gene. Additionally, using RSAT DNA analysis software we identify an androgen response element (ARE) in intron 2 of SEMA3C and show that AR is recruited to this genomic region in an androgen-dependent manner in chromatin immunoprecipitation assays. Furthermore, the isolated ARE binds to the AR-DNA binding domain in gel shift assays and can be transactivated by AR in reporter gene assays. Finally we show that the pioneering factor, GATA2, is necessary for AR-mediated expression of SEMA3C. Collectively, our work identifies SEMA3C as a direct transcriptional target of AR in support of our hypothesis that dysregulated AR signaling drives inadvertent upregulation of SEMA3C and PCa disease progression. Deregulated AR signaling underpins prostate cancer progression and underscores the need to elucidate transcriptional targets of AR. Identification of SEMA3C as a novel target of AR provides the rationale for targeted therapies directed against SEMA3C. Citation Format: Kevin J. Tam, Kush Dalal, Michael Hsing, Chi Wing Cheng, Yan Ting Chiang, Aishwariya Sharma, James W. Peacock, Artem Cherkasov, Yuzhuo Wang, Martin E. Gleave, Paul S. Rennie, Christopher J. Ong. Semaphorin 3C is an androgen receptor-regulated gene. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 1834.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,208
Tête enseignante GPT0,418
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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