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Enregistrement W2502974874 · doi:10.1158/1538-7445.am2016-lb-128

Abstract LB-128: High prevalence of elevated TRPV6 mRNA in pancreatic ductal adenocarcinoma

2016· article· en· W2502974874 sur OpenAlexaff
Tyler Lutes, Dominique Dugourd, Michelle Davey, Christopher Rice, Stéphanie St‐Pierre, Jack Stewart

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensAtlantic Industries (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTRPV6Neuroendocrine tumorsMedicineInternal medicineAdenocarcinomaProstateCancer researchPathologyCancerCalciumCalcium metabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract SOR-C13, a 13-mer peptide derived from soricidin, the paralytic protein component of saliva of the Northern Short-tailed shrew, just completed an open-label, all comers phase I clinical trial for the treatment of epithelial-derived cancers. SOR-C13 is a first-in-class drug candidate that specifically targets and inhibits the TRPV6 calcium channel - a recognized oncochannel over-expressed in a number of epithelial cancers (e.g. breast, ovarian, prostate). TRPV6 over-expression is associated with a poor prognosis particularly with breast and prostate cancers. SOR-C13 is the first TRPV6-targeting drug to enter clinical development. Pancreatic patients were enrolled in the phase I clinical trial for SOR-C13 and for this reason the TRPV6 gene expression in pancreatic tumour biopsies was assessed. Association of TRPV6 oncochannel expression with aggressive pancreatic adenocarcinoma compared to neuroendocrine tumours has never been investigated. Pancreatic adenocarcinoma represents 90% of the pancreatic tumours and is associated with a poor prognosis compared to neuroendocrine tumours. TRPV6 gene expression was assessed in 19 pancreatic tumor biopsies including five adenocarcinoma (Grade I to III), one acinar cell (exocrine), and 13 neuroendocrine (Islet cell) tumors by two-step RT-qPCR. TRPV6 and β-actin (reference gene) mRNA expression was evaluated in duplicate in a reproducible TRPV6 plus β-actin duplex two-step RT-qPCR assay. The acinar cell, and 69% (9/13) of the neuroendocrine tumors had no detectable TRPV6 mRNA expression with >90% of neuroendocrine tumors (12/13) having very little TRPV6 mRNA expression (<30 copies/ng RNA). Of the five pancreatic adenocarcinoma biopsies 4/5 (80%) had 67-285 copies of TRPV6 mRNA/ng RNA, indicating a high level of TRPV6 expression in this type of aggressive pancreatic cancer. The β-actin CT was between 24 and 30 for all tumours (mean 28.5 ± 1.2) indicating that the lack TRPV6 amplification in a majority of the neuroendocrine tumors was not due to RT-qPCR failure or a lack of quality of the biopsy cDNA. Results indicate that drugs specifically targeting TRPV6 oncochannel, like SOR-C13, have the potential to be used to treat the high medical need in pancreatic ductal adenocarcinoma. Citation Format: Tyler Lutes, Dominique Dugourd, Michelle Davey, Christopher Rice, Stephanie St-Pierre, Jack M. Stewart. High prevalence of elevated TRPV6 mRNA in pancreatic ductal adenocarcinoma. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr LB-128.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,461
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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