Abstract 2972: Development and characterization of synthetic antibodies with a human framework that directly link metabolism to immune system in cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Deregulated cellular energetics and evasion of immune system are two hallmark features of cancer cells. In fact, increased uptake of glucose and glutamine by cancer cells elevates flux of a minor glucose pathway known as the hexosamine biosynthetic pathway (HBP), resulting in alteration of glycosylation. Addition of sugar moieties to proteins plays an important role in sensing cellular metabolism, growth factors, signaling molecules, nutrient flux and stress. Since many of these processes are de-regulated in tumorigenesis, global alterations in glycosylation via HBP flux are likely to play an important role in cancer. We hypothesize that cancer cells can “sense” stress through the HBP pathway, and, consequently, reprogram the cell surface and adapt to tougher conditions. Neo-epitopes on the cell surface that emerge from tuning the HBP pathway activity may be prime candidates as readouts that reliably report the status of metabolic reprogramming. In order to advance the understanding of metabolic reprogramming from the perspective of the cell surface, we combined genetics and advanced protein engineering using phage-displayed synthetic human antibody libraries to generate recombinant antibodies (rAbs) that respond to changes in the activity of the HBP. Our method for discovery of surface and nutrient-associated protein sensors (SNAPS) has allowed us to identify multiple human synthetic rAbs whose activity is potentiated under different metabolic states. More specifically, these rAbs recognize cell surface features that discriminate cancer cells with increased HBP flux and effectively recruit components of the immune system to initiate tumor cell lysis. Our findings suggest that the nutrient-dependent cell surface epitopes may have functional roles in defining cancer cell identity and may link multiple cancer hallmarks. Citation Format: Jelena Tomic, Megan McLaughlin, Ron Geyer, Sachdev Sidhu, Jason Moffat. Development and characterization of synthetic antibodies with a human framework that directly link metabolism to immune system in cancer cells. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 2972.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».