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Enregistrement W2503754940 · doi:10.1158/1538-7445.am2016-2860

Abstract 2860: Loss of expression of the metastasis suppressor CREB3L1 is associated with high-grade metastatic breast cancer and poorer prognosis

2016· article· en· W2503754940 sur OpenAlexaff
Paul Mellor, Alison K Ward, Deborah H. Anderson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensSaskatchewan Cancer AgencyUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerMetastasisCancer researchCancerAngiogenesisCancer cellMicroarray analysis techniquesMetastatic breast cancerMedicineTissue microarrayCellBiologyInternal medicineGene expressionGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The unfolded protein response (UPR) is required for proper protein folding in the endoplasmic reticulum under conditions of stress such as those encountered in the tumor microenvironment. Recently, a number of studies have suggested a role for the unfolded protein response in the development of cancer, more specifically in regulating the balance between cell death, dormancy and the growth of cancer cells in the tumor microenvironment. This study examined the role of CREB3L1 (cAMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1), a member of the UPR, in breast cancer development and metastasis. Initial experiments identified the loss of CREB3L1 expression in metastatic breast cancer cell lines compared to low- or non-metastatic cell lines. When metastatic cells were transfected with CREB3L1 they demonstrated reduced invasion and migration in vitro, as well as a significantly decreased ability to survive under non-adherent or hypoxic conditions. Interestingly, in an in vivo rat mammary tumor model, CREB3L1 expressing cells not only failed to form metastases compared to CREB3L1 null cells but regression of the primary tumors was seen in 70% of the animals as a result of impaired angiogenesis. Microarray and ChIP on Chip analyses identified changes in the expression of many genes involved in cancer development and metastasis, including a decrease in those involved in angiogenesis. To determine if these findings translated to human breast cancer, real-time PCR analysis of CREB3L1 expression in human breast cancer tissues of differing grade (n = 213) was performed. Expression of CREB3L1 was elevated in low and medium grade tissue but substantially reduced in high grade tissue, compared to normal. Analysis of the on-line TCGA database of breast cancer samples identified a strong inverse relationship between CREB3L1 gene methylation and the loss of CREB3L1 mRNA expression. Low expression of CREB3L1 was associated with a poorer prognosis with a shorter relapse-free survival for luminal A and triple negative breast cancer patients. These data suggest that CREB3L1 plays an important role in suppressing tumorgenesis and loss of expression is required for the development of a metastatic phenotype. In addition CREB3L1 expression may be a useful marker for determining patient prognosis. Citation Format: Paul Mellor, Alison Ward, Deborah Anderson. Loss of expression of the metastasis suppressor CREB3L1 is associated with high-grade metastatic breast cancer and poorer prognosis. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 2860.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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