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Enregistrement W2504089353 · doi:10.12688/f1000research.8854.1

Networks of fibers and factors: regulation of capsule formation in Cryptococcus neoformans

2016· preprint· en· W2504089353 sur OpenAlexafffund
Hao Ding, François L. Mayer, Eddy Sánchez‐León, Glauber Ribeiro de Sousa Araújo, Susana Frasés, James W. Kronstad

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésCryptococcus neoformansBiologyCapsuleFungusMeningoencephalitisCryptococcosisImmunologyCell biologyMicrobiologyNeuroscienceBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of the pathogenic fungus Cryptococcus neoformans to cause life-threatening meningoencephalitis in immunocompromised individuals is due in large part to elaboration of a capsule consisting of polysaccharide fibers. The size of the cell-associated capsule is remarkably responsive to a variety of environmental and host conditions, but the mechanistic details of the regulation, synthesis, trafficking, and attachment of the polysaccharides are poorly understood. Recent studies reveal a complex network of transcription factors that influence capsule elaboration in response to several different signals of relevance to disease (e.g., iron deprivation). The emerging complexity of the network is consistent with the diversity of conditions that influence the capsule and illustrates the responsiveness of the fungus to both the environment and mammalian hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,210
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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