Abstract 792: Super-transactivation TP53 variant in the germline of a family with Li-Fraumeni variant
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Li-Fraumeni Syndrome (LFS) is a rare autosomal dominant familial cancer syndrome, characterized by multiple malignancies and frequent germline alterations in TP53. In this study, we highlight four unclassified exonic p53 variants detected in patients with a suspected diagnosis of LFS. We report for the first time the discovery of two novel functional variants in codons 191(c.572C>G; p.P191R) and 360 (c.1079G>T; p.G360V), located, respectively, in the DNA binding domain and in a linker region near the tetramerization domain of TP53. Our data revealed that while the P191R variant decreased the transactivation levels of several p53 targets, it failed to segregate with the disease state. The G360V variant, on the other hand, behaved in a paradoxical fashion by causing a stark upregulation in the activity of several p53 response elements. This tumor suppressive effect was also observed at the level of colony formation and c-Caspase 3 activation. While unlikely to be disease-causing, we propose that these variants may represent novel p53 polymorphisms and potential phenotypic modifiers in LFS. In the future, the enhanced transactivation effects of G360V-p53 may also prove useful in designing more efficacious p53-based gene therapies. Citation Format: Badr Id Said, Han Kim, James Tran, Ana Novokmet, David Malkin. Super-transactivation TP53 variant in the germline of a family with Li-Fraumeni variant. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 792.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».