Assessing the effects of 35 European‐derived BMI‐associated SNPs in Mexican children
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: The prevalence of obesity in Mexico has increased at an alarming rate in both adults and children. This study was undertaken to test in Mexican children the effects of single nucleotide polymorphisms (SNP) that have been associated with body mass index (BMI) and obesity in Europeans. METHODS: School-age children (N = 1,559, 5-17 years) were recruited in Mexico City. Thirty-five SNPs with established effects on BMI and obesity were genotyped and analyzed individually and as a combined gene score (GS). RESULTS: SNPs in FAIM2 (rs7138803), GPRC5BB (rs12444979), MTIF3 (rs4771122), TFAP2B (rs987237), TMEM18 (rs7561317), and the GS were significantly associated with BMI. The GS explained 0.9% of the variance of BMI. Also, SNPs in LRRN6C (rs10968576) and MC4R (rs17782313) were significantly associated with overweight and obesity categories, respectively. Importantly, the effect allele frequency of 26/35 SNPs (74.3%) differed significantly between Mexican children and European adults. No significant gene × environment or gene × gene interactions were detected after Bonferroni adjustment. CONCLUSIONS: Several SNPs first associated with BMI/obesity in European adults replicated well in Mexican children, and investigating differences in the distribution of effect alleles across ethnic populations may shed light on genetic susceptibilities of different populations to obesity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».