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Enregistrement W2506835611 · doi:10.1158/1538-7445.am2016-1031

Abstract 1031: Fumarate hydratase deficiency redirects glucose metabolism of hypoxic cancer cells into the pentose phosphate pathway

2016· article· en· W2506835611 sur OpenAlexaff
Luana Schito, Sergio Rey, Judy Pawling, James W. Dennis, Bradly G. Wouters, Marianne Koritzinsky

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransfectionCancer researchGlycolysisPentose phosphate pathwayMolecular biologyHypoxia-inducible factorsChemistryBiochemistryMetabolismGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hypoxia is a common feature of all solid cancers and strongly correlated with poor prognosis. As an adaptive response to hypoxia, cancer cells reprogram their metabolism by increasing glycolysis and reductive carboxylation at the expense of mitochondrial respiration, a phenomenon orchestrated by the transcription factor hypoxia inducible factor (HIF) -1. Mutations in the gene encoding for the mitochondrial enzyme fumarate hydratase (FH), found in the hereditary leiomyomatosis and renal cell carcinoma (HLRCC) syndrome, lead to a similar phenotype despite the presence of O2, a phenomenon due to normoxic stabilization of HIF-1 (pseudohypoxia). Here, we report for the first time that FH loss-of-function (LOF) redirects glucose metabolism into the pentose phosphate pathway (PPP) in non-RCC cells subjected to severe hypoxia (O2< .02%). We show that this metabolic shift favors the buildup of biosynthetic precursors supporting hypoxic cell growth and proliferation. HCT-116 (colon), HeLa (cervix) and H460 (lung) adenocarcinoma cells were transfected with lentiviral vectors encoding for shRNAs targeting FH. Immunoblot analysis showed that FH LOF did not induce pseudohypoxia in these cells. In contrast, HLRCC-derived UOK262 cells showed accumulation of HIF-1 under normoxia which was reversed upon FH re-introduction. A comprehensive analysis utilizing a RT-qPCR array to profile the mRNA expression of 84 HIF-1 target genes, further confirmed that FH LOF did not result in a pseudohypoxic phenotype in HCT-116 cells. An unbiased analysis of 250 metabolites detected by liquid chromatography-tandem mass spectrometry followed by quantitative enrichment analysis, identified glycolysis and the PPP among the most enriched metabolic pathways in hypoxic FH knockdown cells (P< 5×10-8). Since the PPP provides precursors for synthesis of nucleic acids, we analyzed the effect of FH LOF on cell cycle progression and found an inhibition of hypoxia-induced cell cycle arrest in HCT-116 and HeLa cells. Our study reveals novel insights into the effect of FH loss-of-function in cancer cells and indicates a stark contrast between the pseudohypoxic phenotype described in kidney cancer cell lines obtained from HLRCC patients (i.e, UOK-262) and a HIF- independent mechanism of metabolic rerouting in colon, lung and cervix cancer cell lines. Our data show that FH LOF promotes an anabolic phenotype in hypoxic cancer cells that could be exploited to enhance the therapeutic response targeting this resistant subset of cancer cells. Citation Format: Luana Schito, Sergio Rey, Judy Pawling, James W. Dennis, Bradly G. Wouters, Marianne Koritzinsky. Fumarate hydratase deficiency redirects glucose metabolism of hypoxic cancer cells into the pentose phosphate pathway. [abstract]. In: Proceedings of the 107th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2016 Apr 16-20; New Orleans, LA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(14 Suppl):Abstract nr 1031.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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