MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2506867624 · doi:10.1182/blood.v114.22.3649.3649

Molecular Mechanisms of the Pre-TCR Alpha Chain (pTa) Enhancer Transcriptional Regulation by Notch1.

2009· article· en· W2506867624 sur OpenAlexaff
Cédric S. Tremblay, Mathieu Tremblay, Sabine Herblot, Trang Hoang

Notice bibliographique

RevueBlood · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEnhancerT-cell receptorBiologyThymocyteTranscription factorMolecular biologyTranscriptional regulationRegulation of gene expressionGeneGene expressionCell biologyT cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 3649 Poster Board III-585 The Notch1 pathway and pre-TCR signalling are critical regulators of thymocyte development that have been implicated in T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). Although the pre-TCR is required for Notch-dependent T-ALL, the role of pre-TCR alpha (pTa) as a Notch1 target remains controversial. Previous work in our laboratory has shown that the pTa gene is a target gene of the E2A-HEB transcription factors and that the SCL and LMO1 or LMO2 oncogenic transcription factors inhibits E2A activity and pTa expression, thereby causing thymocyte differentiation arrest during the pre-leukemic stage. SCL and LMO1/2 are implicated in 25% of T-ALL cases and induce aggressive T-ALL in transgenic (tg) mice when inappropriately expressed in the thymus. To define the mechanism regulating pTa expression by Notch1 and SCL, we used pTa regulatory sequences as a tool. To this end, we have performed transcriptional assays by co-delivering a luciferase reporter gene construct driven by the 200 bp pTa enhancer sequence with or without SCL or Notch1 intracellular domain (N1ICD), the functional fragment of the Notch1 receptor. Sequence analysis of the pTa enhancer revealed the presence of four E boxes that are potential binding sites for E2A-HEB and a CSL consensus sequence that can recruit the CSL/RBP-Jk transcription factor. Transcriptional assays in double negative thymomas indicated that the integrity of E box 2 and 3 (that recruit E2A-HEB) are essential for pTa enhancer activity in DN thymocytes, confirming the importance of E2A-HEB for pTa expression in these cells. In contrast, the CSL consensus sequence is important but not essential for pTa enhancer activity in these cells, consistent with previous results based on a conditional Notch1 knock out. In the presence of N1ICD, pTa enhancer sequences are strongly activated, either in fibroblasts or in double negative T cell lines in a dose dependent manner. This activation requires the integrity of the CSL consensus sequence but not of the E boxes. Moreover, we found that N1ICD strongly overrides the inhibitory activity of SCL on the pTa enhancer. Inhibition by SCL requires the integrity of E2 and E3 but not the CSL, confirming that SCL inhibits E2A-HEB activity, without affecting N1ICD. Together, our observations indicate that the regulation of pTa enhancer activity by Notch1 and E2A/HEB occur though independent mechanisms. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBloodMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207