MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2507260207 · doi:10.1214/16-ejs1169

Designing penalty functions in high dimensional problems: The role of tuning parameters

2016· article· en· W2507260207 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueElectronic Journal of Statistics · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésPenalty methodCurse of dimensionalityCovariateFeature selectionSelection (genetic algorithm)MathematicsMathematical optimizationComputer scienceStatisticsMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Various forms of penalty functions have been developed for regularized estimation and variable selection. Screening approaches are often used to reduce the number of covariate before penalized estimation. However, in certain problems, the number of covariates remains large after screening. For example, in genome-wide association (GWA) studies, the purpose is to identify Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) that are associated with certain traits, and typically there are millions of SNPs and thousands of samples. Because of the strong correlation of nearby SNPs, screening can only reduce the number of SNPs from millions to tens of thousands and the variable selection problem remains very challenging. Several penalty functions have been proposed for such high dimensional data. However, it is unclear which class of penalty functions is the appropriate choice for a particular application. In this paper, we conduct a theoretical analysis to relate the ranges of tuning parameters of various penalty functions with the dimensionality of the problem and the minimum effect size. We exemplify our theoretical results in several penalty functions. The results suggest that a class of penalty functions that bridges $L_{0}$ and $L_{1}$ penalties requires less restrictive conditions on dimensionality and minimum effect sizes in order to attain the two fundamental goals of penalized estimation: to penalize all the noise to be zero and to obtain unbiased estimation of the true signals. The penalties such as SICA and Log belong to this class, but they have not been used often in applications. The simulation and real data analysis using GWAS data suggest the promising applicability of such class of penalties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,644
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle