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Enregistrement W2507779429 · doi:10.1186/s12885-016-2697-z

The transcriptional regulator TBX3 promotes progression from non-invasive to invasive breast cancer

2016· article· en· W2507779429 sur OpenAlexafffund
Milica Krstic, Connor D. MacMillan, Hon S. Leong, Allen G. Clifford, Lesley Souter, David W. Dales, Carl O. Postenka, Ann F. Chambers, Alan B. Tuck

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsBreast Cancer Society of CanadaMovember Foundation
Mots-clésSurgical oncologyRegulatorBreast cancerMaster regulatorMedicineOncologyInternal medicineCancerCancer researchBiologyTranscription factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: TBX3 is a T-box transcription factor repressor that is elevated in metastatic breast cancer and is believed to promote malignancy of tumor cells, possibly by promoting cell survival and epithelial-mesenchymal transition. METHODS: The relative expression of TBX3 was assessed in the 21T cell lines which were derived from an individual patient and represent three distinct stages of breast cancer progression: 21PT, atypical ductal hyperplasia; 21NT, ductal carcinoma in situ; and 21MT-1, invasive mammary carcinoma. Two different isoforms of TBX3 (TBX3iso1 and TBX3iso2) were overexpressed to evaluate cell survival/colony forming ability, growth, and invasion in the ductal carcinoma in situ-like 21NT cell line using an in vitro Matrigel model of cancer progression. In addition, TBX3 expression was knocked down to evaluate the effects of downregulating TBX3 on the invasive mammary carcinoma-like 21MT-1 cell line. Finally, PCR array profiling was used to assess alterations in gene expression due to TBX3 overexpression in the 21NT cells. RESULTS: TBX3 is abundant in the invasive 21MT-1 cell line, while being minimally expressed in the non-invasive 21NT and 21PT cell lines. Overexpression of either TBX3iso1 or TBX3iso2 in 21NT cells resulted in increased cell survival/colony forming ability, growth vs. apoptosis and invasion in Matrigel. In contrast, short hairpin RNA-mediated knockdown of TBX3 in the 21MT-1 cells resulted in smaller colonies, with a more regular, less dispersed (less infiltrative) morphology. Array profiling of the 21NT TBX3 iso1 and iso2 transfectants showed that there are common alterations in expression of several genes involved in signal transduction, cell cycle control/cell survival, epithelial-mesenchymal transition and invasiveness. CONCLUSIONS: Overall, these results indicate that TBX3 (isoform 1 or 2) expression can promote progression in a model of early breast cancer by altering cell properties involved in cell survival/colony formation and invasiveness, as well as key regulatory and EMT/invasiveness-related gene expressions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,768

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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