Population Differentiation of Ontario Lake trout (Salvelinus namaycush) using the Major Histocompatibility Complex class II β gene
Notice bibliographique
Résumé
The lake trout (Salvelinus namaycush) is a coldwater salmonid with an extensive native distribution across formerly glaciated regions of North America. Lake trout are known to be a glacial ‘relict’ species and evolved as a result of glaciation events during the Pleistocene era. Historic and recent human activities along with climate change have had a significant influence on the phylogeographic and genetic compositions of current lake trout populations. Human activities like overexploitation, habitat degradation and most importantly stocking have had detrimental effects on the diversity and variability of populations within Ontario. Prior genetic studies of lake trout have used multiple neutral genetic marker systems including allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA (mtDNA) to distinguish multiple glacial refugia and phylogeographic lineages within North America. This project differentiated lake trout populations within Ontario using a non-neutral marker, the major histocompatibility (MH) class II beta gene. A total of fifty-seven unique MH class II β1 alleles were identified in 216 individual lake trout from ten lakes across Ontario and one in New York. Native, hatchery stocking sources and native but stocked lake trout populations were characterized for MH diversity and allelic states to assess their diversity and divergence. A geographic map of MH diversity within each lake was completed. Commonly stocked lakes within Ontario have shown a decreased amount of allelic diversity when compared to other populations. The introgression of MH class II beta alleles within the mixed-ancestry populations and the significance of adaptive genetic diversity within and among populations from different histories will be important for the management of lake trout facing future climatic and ecological conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».