MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2508142392 · doi:10.1136/jmedgenet-2016-103966

Meta-analysis of genome-wide association studies of HDL cholesterol response to statins

2016· review· en· W2508142392 sur OpenAlexaff
Iris Postmus, Helen R. Warren, Stella Trompet, Benoît J. Arsenault, Christy L. Avery, Daniel I. Chasman, Catherine E. de Keyser, Harshal Deshmukh, Daniel S. Evans, QiPing Feng, Xiaohui Li, Roelof A. J. Smit, Albert V. Smith, Fangui Sun, Kent D. Taylor, Alice M. Arnold, Michael R. Barnes, Bryan J. Barratt, John Betteridge, S. Matthijs Boekholdt, Eric Boerwinkle, Brendan M. Buckley, Y-D Ida Chen, Anton J. M. de Craen, Steven R. Cummings, Joshua C. Denny, Marie‐Pierre Dubé, Paul N. Durrington, Guðný Eiríksdóttir, Ian Ford, Xiuqing Guo, Tamara B. Harris, Susan R. Heckbert, Albert Hofman, G. Kees Hovingh, John J.P. Kastelein, Leonore J. Launer, Ching‐Ti Liu, Thomas Lumley, Paul McKeigue, Patricia B. Munroe, Andrew Neil, Deborah A. Nickerson, Fredrik Nyberg, Eoin OʼBrien, Christopher J. O’Donnell, Wendy S. Post, Neil R Poulter, Ramachandran S. Vasan, Kenneth Rice, Stephen S. Rich, Fernando Rivadeneira, Naveed Sattar, Peter Sever, Sue Shaw‐Hawkins, Denis C. Shields, P. Eline Slagboom, Nicholas L. Smith, Joshua D. Smith, Nona Sotoodehnia, Alice Stanton, David J. Stott, Bruno H. Stricker, Til Stürmer‎, André G. Uitterlinden, Wei‐Qi Wei, Rudi G. J. Westendorp, Eric A. Whitsel, Kerri L. Wiggins, Russell A. Wilke, Christie M. Ballantyne, Helen M. Colhoun, L. Adrienne Cupples, Oscar H. Franco, Vilmundur Guðnason, G. A. Hitman, Bruce M. Psaty, Paul M. Ridker, Jeanette M. Stafford, Charles Stein, Jean‐Claude Tardif, Mark J. Caulfield, J. Wouter Jukema, Jerome I. Rotter, Ronald M. Krauss

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute on AgingNational Center for Advancing Translational SciencesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthHjartaverndErasmus Medisch CentrumNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustEuropean CommissionSchool of Medicine, Boston UniversityImperial College LondonJohns Hopkins UniversityErasmus Universiteit RotterdamBristol-Myers SquibbAstraZenecaNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentZonMwWake Forest UniversityNational Heart, Lung, and Blood InstitutePfizerDiabetes UK
Mots-clésCholesterolGenome-wide association studyAssociation (psychology)GeneticsGenetic associationBiologyComputational biologyBioinformaticsInternal medicineMedicineSingle-nucleotide polymorphismPsychologyGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background In addition to lowering low density lipoprotein cholesterol (LDL-C), statin therapy also raises high density lipoprotein cholesterol (HDL-C) levels. Inter-individual variation in HDL-C response to statins may be partially explained by genetic variation. Methods and results We performed a meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) to identify variants with an effect on statin-induced high density lipoprotein cholesterol (HDL-C) changes. The 123 most promising signals with p<1×10 −4 from the 16 769 statin-treated participants in the first analysis stage were followed up in an independent group of 10 951 statin-treated individuals, providing a total sample size of 27 720 individuals. The only associations of genome-wide significance (p<5×10 −8 ) were between minor alleles at the CETP locus and greater HDL-C response to statin treatment. Conclusions Based on results from this study that included a relatively large sample size, we suggest that CETP may be the only detectable locus with common genetic variants that influence HDL-C response to statins substantially in individuals of European descent. Although CETP is known to be associated with HDL-C, we provide evidence that this pharmacogenetic effect is independent of its association with baseline HDL-C levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,804
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,003
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,143
Tête enseignante GPT0,428
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medical GeneticsMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207