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Enregistrement W2508598819 · doi:10.1371/journal.pone.0161018

A Reassessment of the Impact of European Contact on the Structure of Native American Genetic Diversity

2016· article· en· W2508598819 sur OpenAlex
Keith Hunley, Kiela Gwin, Brendan Liberman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBeringiaGenetic diversityMesoamericaGene poolBiologyDiversity (politics)Genetic admixtureGenetic structureEvolutionary biologyGeographyEcologyDemographyPopulationArchaeologyAnthropology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our current understanding of pre-Columbian history in the Americas rests in part on several trends identified in recent genetic studies. The goal of this study is to reexamine these trends in light of the impact of post-Columbian admixture and the methods used to study admixture. The previously-published data consist of 645 autosomal microsatellite genotypes from 1046 individuals in 63 populations. We used STRUCTURE to estimate ancestry proportions and tested the sensitivity of these estimates to the choice of the number of clusters, K. We used partial correlation analyses to examine the relationship between gene diversity and geographic distance from Beringia, controlling for non-Native American ancestry (from Africa, Europe and East Asia), and taking into account alternative paths of migration. Principal component analysis and multidimensional scaling were used to investigate the relationships between Andean and non-Andean populations and to explore gene-language correspondence. We found that 1) European and East Asian ancestry estimates decline as K increases, especially in Native Canadian populations, 2) a north-south decline in gene diversity is driven by low diversity in Amazonian and Paraguayan populations, not serial founder effects from Beringia, 3) controlling for non-Native American ancestry, populations in the Andes and Mesoamerica have higher gene diversity than populations in other regions, and 4) patterns of genetic and linguistic diversity are poorly correlated. We conclude that patterns of diversity previously attributed to pre-Columbian processes may in part reflect post-Columbian admixture and the choice of K in STRUCTURE analyses. Accounting for admixture, the pattern of diversity is inconsistent with a north-south founder effect process, though the genetic similarities between Mesoamerican and Andean populations are consistent with rapid dispersal along the western coast of the Americas. Further, even setting aside the disruptive effects of European contact, gene-language congruence is unlikely to have ever existed at the geographic scale analyzed here.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,431
Score d'incertitude au seuil0,123

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle