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Enregistrement W2508602197 · doi:10.1139/gen-2015-0166

Is <i>Nematocharax</i> (Actinopterygii, Characiformes) a monotypic fish genus?

2016· article· en· W2508602197 sur OpenAlexvenueno aff
Silvia Britto Barreto, Lorena Andrade Nunes, André Teixeira da Silva, Ricardo Jucá‐Chagas, Débora Diniz, Iracilda Sampaio, Horácio Schneider, Paulo Roberto Antunes de Mello Affonso

Notice bibliographique

RevueGenome · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish biology, ecology, and behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituto Chico Mendes de Conservação da BiodiversidadeUniversidade Estadual do Sudoeste da BahiaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia
Mots-clésBiologyActinopterygiiGenetic divergenceZoologyGenusCharaciformesEvolutionary biologyMorphometricsCytochrome c oxidase subunit IBiological dispersalCichlidEcologyGenetic diversityPhylogenetic treeFish <Actinopterygii>PopulationFisheryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The combination of DNA barcodes and geometric morphometrics is useful to discriminate taxonomically controversial species, providing more precise estimates of biodiversity. Therefore, our goal was to assess the genetic and morphometric diversity in Nematocharax, a controversial monotypic and sexually dimorphic genus of Neotropical fish, based on sequencing of cytochrome c oxidase subunit I (COI) and morphometric analyses in seven populations of N. venustus from coastal rivers in Brazil. The average pairwise intrapopulation divergence in COI ranged from 0 to 2.2%, while the average pairwise interpopulation divergence varied from 0 to 7.5%. The neighbour-joining (NJ) tree resulted in five genetic groups (bootstrap ≥ 97%), which correspond to the five clusters delimited by the BIN System, GMYC, and bPTP, indicating that there might be at least five species (or OTUs) within Nematocharax. Morphometric differences among these genetic lineages were also identified. Apparently, sexual selection, restricted dispersal, and geographic isolation might have acted synergistically to cause the evolutionary split of populations. These data challenge the current view that Nematocharax is a monotypic genus inasmuch as evolutionarily significant units or even distinguished species were identified. Therefore, we recommend that the highly impacted coastal basins in northeastern Brazil should be prioritized in conservation plans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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