MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2508835857 · doi:10.1016/j.gdata.2016.08.017

Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate and cancer: Evaluation of a possible common genetic background through the analysis of GWAS data

2016· article· en· W2508835857 sur OpenAlex
Eva Dunkhase, Kerstin U. Ludwig, Michael Knapp, Christine F. Skibola, Jane C. Figueiredo, Fay J. Hosking, Eva Ellinghaus, Maria Teresa Landi, Hongxia Ma, Hidewaki Nakagawa, Jong‐Won Kim, Jiali Han, Ping Yang, Anne C. Böhmer, Manuel Mattheisen, Markus M. Nöthen, Elisabeth Mangold

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenomics Data · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCleft Lip and Palate Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Public Health ServiceNanjing Medical UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftMayo Foundation for Medical Education and ResearchJohns Hopkins UniversityHenry Ford Health SystemUniversity of California, Los AngelesInstitut National Du CancerUniversity of MinnesotaUniversity of PittsburghDeutsche KrebshilfeEuropean Regional Development FundEuropean CommissionGeorgetown UniversityInstitute of Cancer ResearchUniversity of Colorado DenverMayo ClinicNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismCancerGeneticsBiologyGenetic associationCarcinogenesisBioinformaticsComputational biologyGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous research suggests a genetic overlap between nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) and cancer. The aim of the present study was to identify common genetic risk loci for NSCL/P and cancer entities that have been reported to co-occur with orofacial clefting. This was achieved through the investigation of large genome-wide association study datasets. Investigations of 12 NSCL/P single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 32 cancer datasets, and 204 cancer SNPs in two NSCL/P datasets, were performed. The SNPs rs13041247 (20q12) and rs6457327 (6p21.33) showed suggestive evidence for an association with both NSCL/P and a specific cancer entity. These loci harbor genes of biological relevance to oncogenesis (MAFB and OCT4, respectively). This study is the first to characterize possible pleiotropic risk loci for NSCL/P and cancer in a systematic manner. The data represent a starting point for future research by identifying a genetic link between NSCL/P and cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,239
Score d'incertitude au seuil0,515

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,126
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle