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Enregistrement W2509440010 · doi:10.1158/1557-3125.myc15-a08

Abstract A08: Identification of c-MYC SUMOylation by mass spectrometry

2015· article· en· W2509440010 sur OpenAlexaff
Manpreet Kalkat, Pak-Kei Chan, Amanda R. Wasylishen, Tharan Srikumar, Sam S. Kim, Romina Ponzielli, David P. Bazett‐Jones, Brian Raught, Linda Z. Penn

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSUMO proteinUbiquitin ligaseUbiquitinPost-translational regulationCell biologyPhosphorylationImmunoprecipitationTranscriptional regulationBiologyTranscription factorChemistryCancer researchBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The c-MYC transcription factor is a master regulator of many cellular processes and deregulation of this oncogene has been linked to more than 50% of all cancers. In normal cells, MYC is tightly controlled at a number of steps, including at the transcriptional, translational and post-translational levels. Altered regulation at any of these steps can result in deregulated, oncogenic MYC. One well-studied canonical pathway that is known to regulate MYC activity and stability at the post-translational level is the GSK3 pathway. The GSK3-FBXW7 axis regulates MYC via phosphorylation at T58, followed by ubiquitylation of MYC by the E3 ubiquitin ligase complex SCF-FBXW7 and subsequent proteasomal degradation. Accordingly, substituting threonine 58 with alanine (T58A) confers increased stability and transformative potential. Thus, characterizing the post-translational modifications (PTMs) of MYC can lead to a better understanding of the regulatory mechanisms controlling this potent oncogene. SUMOylation is a post-translational modification that utilizes a series of E1, E2 and E3 proteins for conjugation of a small ubiquitin-like modifier (SUMO) moiety to its target protein. Growing evidence indicates that SUMOylation has many important roles in the cell, such as response to cellular stressors and transcriptional regulation. Moreover, recent reports have unveiled a potential role for SUMOylation in MYC-driven tumourigenesis. Here, using immunoprecipitation combined with mass spectrometry, we identified a MYC SUMOylation site (K326). Abrogation of signaling through this residue by substitution with arginine (K326R) has no obvious effects on MYC half-life, intracellular localization, transcriptional targets, nor on the biological effects of MYC overexpression in three different cell systems assessed for soft agar colony formation, proliferation, and apoptosis. While we have definitively demonstrated that MYC SUMOylation can occur on K326, future work will be needed to elucidate the mechanisms and biological significance of MYC regulation by SUMOylation. Citation Format: Manpreet Kalkat, Pak-Kei Chan, Amanda R. Wasylishen, Tharan Srikumar, Sam S. Kim, Romina Ponzielli, David P. Bazett-Jones, Brian Raught, Linda Z. Penn. Identification of c-MYC SUMOylation by mass spectrometry. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Myc: From Biology to Therapy; Jan 7-10, 2015; La Jolla, CA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Res 2015;13(10 Suppl):Abstract nr A08.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,437

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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