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Enregistrement W2509465192

Towards a Common Format for Computational Materials Science Data

2016· preprint· en· W2509465192 sur OpenAlexfundno aff
Luca M. Ghiringhelli, Christian Carbogno, Sergey V. Levchenko, Fawzi Mohamed, Georg Huhs, Martin Lüders, Micael J. T. Oliveira, Matthias Scheffler

Notice bibliographique

RevueMPG.PuRe (Max Planck Society) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBanting and Best Diabetes Centre, University of TorontoEuropean Commission
Mots-clésStandardizationComputer scienceMetadataCode (set theory)File formatData exchangeSoftwareData scienceData structureSoftware engineeringInformation retrievalWorld Wide WebProgramming language
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Information and data exchange is an important aspect of scientific progress.In computational materials science, a prerequisite for smooth data exchange is standardization, which means using agreed conventions for, e.g., units, zero base lines, and file formats.There are two main strategies to achieve this goal.One accepts the heterogeneous nature of the community which comprises scientists from physics, chemistry, bio-physics, and materials science, by complying with the diverse ecosystem of computer codes and thus develops "converters" for the input and output files of all important codes.These converters then translate the data of all important codes into a standardized, code-independent format.The other strategy is to provide standardized open libraries that code developers can adopt for shaping their inputs, outputs, and restart files, directly into the same code-independent format.We like to emphasize in this paper that these two strategies can and should be regarded as complementary, if not even synergetic.The main concepts and software developments of both strategies are very much identical, and, obviously, both approaches should give the same final result.In this paper, we present the appropriate format and conventions that were agreed upon by two teams, the Electronic Structure Library (ESL) of CECAM and the NOMAD (NOvel MAterials Discovery) Laboratory, a European Centre of Excellence (CoE).This discussion includes also the definition of hierarchical metadata describing state-of-the-art electronic-structure calculations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,040
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,101
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,987
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0400,101
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0130,016
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0220,020
Science ouverte0,0130,017
Intégrité de la recherche0,0060,016
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,015

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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