CLIC5: a novel ETV6 target gene in childhood acute lymphoblastic leukemia
Notice bibliographique
Résumé
The most common rearrangement in childhood precursor B-cell acute lymphoblastic leukemia is the t(12;21)(p13;q22) translocation resulting in the ETV6-AML1 fusion gene. A frequent concomitant event is the loss of the residual ETV6 allele suggesting a critical role for the ETV6 transcriptional repressor in the etiology of this cancer. However, the precise mechanism through which loss of functional ETV6 contributes to disease pathogenesis is still unclear. To investigate the impact of ETV6 loss on the transcriptional network and to identify new transcriptional targets of ETV6, we used whole transcriptome analysis of both pre-B leukemic cell lines and patients combined with chromatin immunoprecipitation. Using this integrative approach, we identified 4 novel direct ETV6 target genes: CLIC5, BIRC7, ANGPTL2 and WBP1L To further evaluate the role of chloride intracellular channel protein CLIC5 in leukemogenesis, we generated cell lines overexpressing CLIC5 and demonstrated an increased resistance to hydrogen peroxide-induced apoptosis. We further described the implications of CLIC5's ion channel activity in lysosomal-mediated cell death, possibly by modulating the function of the transferrin receptor with which it colocalizes intracellularly. For the first time, we showed that loss of ETV6 leads to significant overexpression of CLIC5, which in turn leads to decreased lysosome-mediated apoptosis. Our data suggest that heightened CLIC5 activity could promote a permissive environment for oxidative stress-induced DNA damage accumulation, and thereby contribute to leukemogenesis.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».